162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1374 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 363 aa  732    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  40.11 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  34.31 
 
 		 358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  33.04 
 
 		 381 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  35.06 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  33.89 
 
 		 357 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02856  conserved hypothetical protein  34.52 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000121999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02805  hypothetical protein  34.52 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000010354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0713  permease YjgP/YjgQ family protein  34.52 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3265  YjgP/YjgQ permease  34.23 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.342085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3160  YjgP/YjgQ permease  33.93 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3447  YjgP/YjgQ permease  33.82 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  33.24 
 
 		 372 aa  149  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  28.61 
 
 		 370 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  29.18 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  29.94 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  29.33 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  28.9 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  27.75 
 
 		 375 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  27.71 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  28 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  28 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  28 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  27.92 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  28 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  28.61 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  32.76 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  28.32 
 
 		 371 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  28.32 
 
 		 383 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  29.94 
 
 		 372 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.13 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  27.98 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  26.54 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  27.98 
 
 		 369 aa  126  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  27.85 
 
 		 370 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  26.44 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  27.07 
 
 		 373 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  28.61 
 
 		 370 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  28.61 
 
 		 370 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  29.28 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  27.68 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  27.79 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  28.57 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  25.73 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.74 
 
 		 370 aa  119  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  26.22 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  25.63 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  25.74 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  26.82 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  27.83 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  25.48 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  23.88 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  27.71 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 358 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  27.86 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  25.36 
 
 		 369 aa  109  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  28.7 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  28.32 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  27.45 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  26.45 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  26.17 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02661  putative permease, YjgP/YjgQ family  27.08 
 
 		 360 aa  99.4  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  22.86 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  22.57 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 		 372 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  25.92 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  26.85 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  25.79 
 
 		 372 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0537  permease YjgP/YjgQ family protein  25.75 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613487  normal  0.97553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  20.86 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  21.58 
 
 		 365 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  21.21 
 
 		 364 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  21.21 
 
 		 364 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  21.21 
 
 		 364 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  21.58 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  21.58 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  21.2 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  21.52 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  21.58 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  21.58 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  21.58 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  21.58 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  21.52 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  26.56 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  25.95 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  22.69 
 
 		 373 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  25.22 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0563  permease YjgP/YjgQ family protein  28.1 
 
 		 364 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000298554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  21.2 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  25.07 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  25.07 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  25.2 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>