More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0068 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  42.11 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  41.67 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  43.8 
 
 		 158 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1355  hypothetical protein  60.95 
 
 		 150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.133793  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  43.8 
 
 		 158 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  38.61 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  38.46 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  38.61 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  38.71 
 
 		 159 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  44.08 
 
 		 167 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  42.75 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  43.59 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  37.74 
 
 		 162 aa  101  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  40.15 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  47.37 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  40.7 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  39.1 
 
 		 174 aa  99.8  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  45.24 
 
 		 147 aa  99  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  41.56 
 
 		 159 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  43.59 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  39.47 
 
 		 159 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  39.52 
 
 		 147 aa  96.7  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  37.11 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  36.48 
 
 		 171 aa  95.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  38.52 
 
 		 155 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  39.66 
 
 		 158 aa  93.6  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  43.22 
 
 		 154 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  46.43 
 
 		 163 aa  92.8  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  44.35 
 
 		 167 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  40.13 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  36.14 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  43.42 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  34.78 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1155  hypothetical protein  27.86 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.8201  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  38.41 
 
 		 167 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0927  hypothetical protein  27.89 
 
 		 154 aa  89.7  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  39.49 
 
 		 171 aa  88.2  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.35 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  39.39 
 
 		 149 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.91 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  39.17 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.35 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.91 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.35 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.35 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  37.84 
 
 		 160 aa  86.3  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  46.67 
 
 		 169 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  38.71 
 
 		 157 aa  85.9  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  43.36 
 
 		 129 aa  85.9  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  39.13 
 
 		 154 aa  85.1  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  36.96 
 
 		 185 aa  85.1  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  35.77 
 
 		 158 aa  84.7  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  39.47 
 
 		 237 aa  84.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  39.2 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  40.85 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  31.03 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.68 
 
 		 274 aa  81.6  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  35 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  37.06 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  38.52 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  36.52 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  39.17 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  34.56 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  35.16 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  31.97 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  34.56 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  39 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  34.56 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  34.56 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  34.56 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.4 
 
 		 270 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.4 
 
 		 270 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.4 
 
 		 270 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.4 
 
 		 270 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  35.82 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.4 
 
 		 270 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.4 
 
 		 270 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  35.54 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  36.04 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.4 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  38.53 
 
 		 127 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  36.92 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  33.33 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.4 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  35.25 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  37.9 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  40 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  36.28 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  38.14 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  36.61 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  41.82 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  41.41 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  36.61 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  43.09 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  39.17 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>