45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0564 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 739 aa  1516    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  30.96 
 
 		 542 aa  183  8.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  25.46 
 
 		 501 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  23.86 
 
 		 624 aa  87.4  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  24.75 
 
 		 507 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  23.74 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  23.64 
 
 		 697 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  27.27 
 
 		 857 aa  63.9  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  22.81 
 
 		 771 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  24.66 
 
 		 612 aa  60.8  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  24.9 
 
 		 632 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  23.59 
 
 		 636 aa  60.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  23.37 
 
 		 717 aa  58.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  23.05 
 
 		 717 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  22.8 
 
 		 1061 aa  57.4  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  21.43 
 
 		 798 aa  57.4  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  25.34 
 
 		 1036 aa  56.2  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  22.99 
 
 		 477 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  22.78 
 
 		 717 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  27.03 
 
 		 1039 aa  55.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  26.07 
 
 		 1172 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  26.07 
 
 		 1172 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  24.19 
 
 		 757 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  22.92 
 
 		 777 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  22.92 
 
 		 777 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  20.35 
 
 		 900 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  22.98 
 
 		 769 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5881  DNA primase catalytic core domain protein  24.19 
 
 		 1117 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  22.92 
 
 		 777 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  24.07 
 
 		 746 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  24.07 
 
 		 746 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  23.99 
 
 		 843 aa  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  22.18 
 
 		 777 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  22.34 
 
 		 1285 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  22.03 
 
 		 486 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  26.73 
 
 		 788 aa  49.7  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  21.82 
 
 		 777 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  20 
 
 		 782 aa  48.5  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  20.28 
 
 		 695 aa  47.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  23.15 
 
 		 777 aa  47.4  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  23.55 
 
 		 978 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  22.48 
 
 		 828 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  21.92 
 
 		 605 aa  45.8  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  22.04 
 
 		 725 aa  44.3  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  22.22 
 
 		 842 aa  43.9  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>