More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0394 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
175 aa  363  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  74.86 
 
 
175 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  75.14 
 
 
174 aa  277  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  76.19 
 
 
174 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  76.19 
 
 
174 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  76.19 
 
 
174 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  75.45 
 
 
218 aa  271  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  76.73 
 
 
167 aa  265  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  76.07 
 
 
194 aa  265  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  75.47 
 
 
217 aa  260  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  75.76 
 
 
199 aa  259  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  75.78 
 
 
171 aa  259  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  75.47 
 
 
211 aa  258  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  72 
 
 
196 aa  258  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  72.39 
 
 
203 aa  256  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.52 
 
 
254 aa  256  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  73.01 
 
 
171 aa  255  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  72.39 
 
 
183 aa  254  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  73.29 
 
 
214 aa  253  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  70.06 
 
 
247 aa  253  8e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  69.1 
 
 
185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.01 
 
 
226 aa  252  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  66.67 
 
 
188 aa  249  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  73.72 
 
 
211 aa  248  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  69.81 
 
 
187 aa  244  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  69.05 
 
 
252 aa  243  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  66.47 
 
 
300 aa  239  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  69.03 
 
 
185 aa  238  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  66.27 
 
 
211 aa  235  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  65.66 
 
 
211 aa  234  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.78 
 
 
229 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  55.81 
 
 
177 aa  157  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.24 
 
 
199 aa  152  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.68 
 
 
179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.28 
 
 
177 aa  147  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.55 
 
 
175 aa  144  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50.72 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.52 
 
 
165 aa  138  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.62 
 
 
168 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  46.38 
 
 
176 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  44.93 
 
 
184 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  49.22 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  45.45 
 
 
162 aa  124  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.8 
 
 
181 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  42.36 
 
 
175 aa  120  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  40.44 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  44.7 
 
 
163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  52.07 
 
 
164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  52.07 
 
 
164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
171 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.88 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
180 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  45.19 
 
 
182 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  44.27 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  51.24 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  43.94 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  45.93 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  39.13 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  44.7 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.65 
 
 
188 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  39.13 
 
 
176 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
182 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  44.44 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  44.96 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.79 
 
 
170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  43.51 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
171 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.43 
 
 
169 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
182 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1041  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.78 
 
 
165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
163 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
163 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.01 
 
 
171 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  45.16 
 
 
180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  41.01 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  41.01 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.53 
 
 
170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  45.16 
 
 
180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  45.97 
 
 
180 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  45.97 
 
 
180 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
162 aa  111  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  45.97 
 
 
180 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  45.97 
 
 
180 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  45.97 
 
 
180 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  41.01 
 
 
180 aa  111  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  41.01 
 
 
180 aa  111  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
163 aa  111  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
163 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.61 
 
 
197 aa  111  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
163 aa  111  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  45.16 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>