264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0784 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 179 aa  371  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  64.97 
 
 		 179 aa  250  7e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  66.1 
 
 		 178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  61.45 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  51.96 
 
 		 178 aa  191  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  39.16 
 
 		 180 aa  124  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  32.6 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  33.52 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  30.9 
 
 		 177 aa  97.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  31.28 
 
 		 204 aa  92.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 		 192 aa  91.3  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 		 201 aa  91.3  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 190 aa  90.9  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 		 190 aa  89  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 		 206 aa  88.6  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  28.07 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  31.98 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 		 194 aa  84.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  34.01 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  40.59 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  39.64 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  37.76 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  32.07 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  35.25 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  40.59 
 
 		 246 aa  80.9  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  34.51 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  30.07 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  34.51 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  27.67 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  37.72 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  26.99 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  36.89 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  40.59 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  28.98 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  27.98 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3308  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000769762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  28.09 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  30.86 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  37.62 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.89 
 
 		 321 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 		 217 aa  74.3  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  38.46 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  32.62 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3414  NADPH-dependent FMN reductase  30.72 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.63 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  36 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  28.27 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 		 222 aa  72  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1636  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.68 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 		 262 aa  71.2  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  28.36 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  29.02 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  25.53 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.22 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  37.38 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  26.62 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0542  iron-sulfur flavoprotein, putative  31.82 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.423785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>