200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0783 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  100 
 
 		 356 aa  734    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  74.44 
 
 		 354 aa  555  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  78.11 
 
 		 342 aa  541  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  71.59 
 
 		 360 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  71.6 
 
 		 351 aa  534  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  71.02 
 
 		 360 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  74.71 
 
 		 355 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  70.55 
 
 		 342 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  73.24 
 
 		 342 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  72.65 
 
 		 342 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  72.83 
 
 		 336 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  74.77 
 
 		 321 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  71.09 
 
 		 345 aa  507  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  70.5 
 
 		 355 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  65.81 
 
 		 355 aa  495  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  73.77 
 
 		 305 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  69.12 
 
 		 342 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  68.24 
 
 		 337 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  53.94 
 
 		 330 aa  346  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1359  membrane protein  53.35 
 
 		 347 aa  345  8e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  52.81 
 
 		 320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  52.83 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  51.59 
 
 		 346 aa  328  8e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  51.25 
 
 		 329 aa  325  5e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  51.9 
 
 		 362 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  48.43 
 
 		 318 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  50.3 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  48.56 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  46.75 
 
 		 372 aa  282  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  47.63 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  45.1 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  46.82 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  46.03 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  43.94 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  47.28 
 
 		 368 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  43.1 
 
 		 358 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  49.05 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  40.21 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  43.28 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0327  hydrolase of the alpha/beta family protein  42.39 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  0.920722 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03774  alpha/beta superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16580)  53.33 
 
 		 237 aa  237  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1355  hydrolase of the alpha/beta superfamily  36.24 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1801  peptidase S15  43.67 
 
 		 359 aa  222  7e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0921654  normal  0.010289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0389  hypothetical protein  46.73 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  39.26 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  40.26 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  38.7 
 
 		 302 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  35.13 
 
 		 312 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  34.94 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  34.84 
 
 		 306 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  34.52 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  34.52 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  34.52 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  34.19 
 
 		 306 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  37.71 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  33.87 
 
 		 310 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  33.87 
 
 		 310 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  33.87 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  33.87 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  33.9 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3213  hypothetical protein  35.01 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2478  hypothetical protein  35.67 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000532827  normal  0.854923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2082  hypothetical protein  35.67 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0227342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2191  alpha/beta fold family hydrolase  35.67 
 
 		 363 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3245  hypothetical protein  34.88 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7287  alpha/beta fold family hydrolase  33.55 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  34.52 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32340  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  35.45 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  32.71 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3911  hypothetical protein  36 
 
 		 367 aa  159  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0552429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4372  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.29 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000526664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  33.12 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  34.88 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2528  dienelactone hydrolase domain protein  34.81 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0060  dienelactone hydrolase domain-containing protein  35.96 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198553  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0061  dienelactone hydrolase domain-containing protein  35.96 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  40.59 
 
 		 237 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1211  alpha/beta fold family hydrolase  35.44 
 
 		 310 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0326  hypothetical protein  30.77 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0346  hypothetical protein  31.08 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1824  hypothetical protein  30.22 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7269  alpha/beta fold family hydrolase  30.06 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  30.75 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2928  hypothetical protein  30.28 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1060  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.711691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1539  hypothetical protein  28.21 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1979  putative dienelactone hydrolase-related enzyme  28.17 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.559039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  27.61 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5433  hypothetical protein  38.53 
 
 		 132 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571739  normal  0.957885 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  27.69 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  27.57 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  25.18 
 
 		 298 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  28.57 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  27.12 
 
 		 304 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  29.01 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  28.26 
 
 		 301 aa  87  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>