More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2057 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 113 aa  226  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  61.17 
 
 		 105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 105 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  61.39 
 
 		 105 aa  135  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  60.55 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  64.65 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  64.65 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  64.65 
 
 		 104 aa  130  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  64.65 
 
 		 104 aa  130  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  64.65 
 
 		 104 aa  130  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  64.65 
 
 		 104 aa  130  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  64.65 
 
 		 104 aa  130  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  63.64 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 104 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  55 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  55.67 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  56.12 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3884  putative transcriptional regulator  46.46 
 
 		 116 aa  103  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  38.39 
 
 		 127 aa  93.6  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 117 aa  93.2  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  46 
 
 		 113 aa  90.9  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 159 aa  90.5  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  45.26 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  47.25 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  38.89 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  39 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  40.19 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  40.19 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  40.19 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  40.19 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  40.19 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  40.19 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  40.19 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  40.19 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  40.19 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  39.78 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  45.98 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  44.55 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  39.78 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  44.57 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  43.56 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  38.3 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  43.48 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  40.86 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  43.56 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  43.56 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  46.24 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  43.56 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  39 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>