More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1510 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  77.42 
 
 
250 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  60.4 
 
 
249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  60 
 
 
250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  60 
 
 
250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  60 
 
 
250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  59.18 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  59.59 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  59.59 
 
 
250 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  59.18 
 
 
250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  59.59 
 
 
250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  59.59 
 
 
250 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  59.59 
 
 
250 aa  299  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  53.63 
 
 
248 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  53.23 
 
 
248 aa  265  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
253 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  45.9 
 
 
253 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  46.12 
 
 
252 aa  226  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  45.12 
 
 
248 aa  208  8e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  46.09 
 
 
247 aa  205  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  47.64 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  42.73 
 
 
236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  42.49 
 
 
252 aa  177  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  40.41 
 
 
247 aa  176  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  39.59 
 
 
245 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  40.97 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
244 aa  157  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0635  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
247 aa  155  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
274 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37.29 
 
 
256 aa  154  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
256 aa  153  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 
245 aa  151  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.66 
 
 
250 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
269 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.73 
 
 
258 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  40.08 
 
 
267 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.61 
 
 
258 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3257  transcriptional regulator, DeoR family  37 
 
 
251 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.9425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 
253 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.08 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  33.87 
 
 
248 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
260 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  34.91 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.93 
 
 
253 aa  131  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.76 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  34.8 
 
 
253 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1053  DeoR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 
254 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
257 aa  128  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  33.63 
 
 
260 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
260 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
260 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
260 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
260 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  33.63 
 
 
260 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  30.52 
 
 
257 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 
266 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
260 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  33.63 
 
 
260 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  34.05 
 
 
254 aa  125  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  32.19 
 
 
254 aa  125  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
253 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
256 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
254 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
288 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
255 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
255 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
255 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 
257 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 
268 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  31.54 
 
 
257 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
255 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  36.02 
 
 
255 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
255 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  32.05 
 
 
267 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  34.82 
 
 
257 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.05 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  34.8 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  35.55 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  35.05 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  27.57 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  35.12 
 
 
282 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6108  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  36.71 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  33.75 
 
 
278 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 
254 aa  118  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  34.26 
 
 
263 aa  118  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>