More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1189 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1189  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  100 
 
 
605 aa  1250    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0255712  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0077  reverse transcriptase  43.08 
 
 
632 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0589009  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0089  reverse transcriptase  43.08 
 
 
632 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2082  RNA-directed DNA polymerase  38.7 
 
 
635 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3857  reverse transcriptase/endonuclease protein  37.72 
 
 
604 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0013  group II intron reverse transcriptase/maturase  36.09 
 
 
599 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.631939 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0466  group II intron reverse transcriptase/maturase  35.64 
 
 
599 aa  302  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0016  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.82 
 
 
642 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3691  reverse transcriptase/endonuclease  33.82 
 
 
642 aa  300  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0120  reverse transcriptase  33.82 
 
 
642 aa  300  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3699  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.82 
 
 
642 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3675  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.82 
 
 
642 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0018  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.82 
 
 
642 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.213024 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0034  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.85 
 
 
627 aa  299  9e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2751  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.78 
 
 
618 aa  296  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0035  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.39 
 
 
643 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4163  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.11 
 
 
610 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1884  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.11 
 
 
610 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4056  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.11 
 
 
610 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1054  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.11 
 
 
610 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.200427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1017  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.11 
 
 
610 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0781817  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0165  group II intron reverse transcriptase/maturase  33.11 
 
 
610 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508109  hitchhiker  6.15504e-23 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  39.87 
 
 
587 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  31.89 
 
 
483 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  33.51 
 
 
488 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4556  group II intron-encoded protein LtrA  32.61 
 
 
604 aa  190  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000506643  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1762  group II intron-encoded protein LtrA  32.61 
 
 
604 aa  190  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.255924  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5597  group II intron-encoded protein LtrA  32.61 
 
 
604 aa  190  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.147853  hitchhiker  0.000000000602263 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3928  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.5 
 
 
633 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2196  RNA-directed DNA polymerase  29.5 
 
 
633 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.035125  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  33.5 
 
 
439 aa  185  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1685  retron-type reverse transcriptase  31.91 
 
 
599 aa  184  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.950387  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1349  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.72 
 
 
457 aa  183  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000323944  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.01 
 
 
507 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0664  RNA-directed DNA polymerase  31.49 
 
 
605 aa  182  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C19  maturase MatR  31.69 
 
 
599 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1921  RNA-directed DNA polymerase  31.86 
 
 
595 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2269  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  33.51 
 
 
446 aa  181  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.295773  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0248  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.72 
 
 
460 aa  179  9e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000485137  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1430  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.17 
 
 
460 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.78 
 
 
648 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.78 
 
 
648 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0498  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.17 
 
 
460 aa  177  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0688  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.17 
 
 
390 aa  177  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000168901  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0231  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.17 
 
 
460 aa  177  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0939  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.17 
 
 
460 aa  177  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000533516  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0963  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.17 
 
 
460 aa  177  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.120749  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1089  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.17 
 
 
460 aa  177  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000601644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0093  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.17 
 
 
460 aa  177  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1257  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.17 
 
 
460 aa  177  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3937  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.83 
 
 
613 aa  177  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4607  RNA-directed DNA polymerase  30 
 
 
593 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2960  RNA-directed DNA polymerase  30 
 
 
593 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4361  RNA-directed DNA polymerase  30 
 
 
593 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  34.79 
 
 
492 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2231  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  36.49 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000756298 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1533  RNA-directed DNA polymerase  31.47 
 
 
607 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3169  RNA-directed DNA polymerase  31.22 
 
 
543 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.95 
 
 
607 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.95 
 
 
607 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.95 
 
 
607 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.95 
 
 
607 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  35.12 
 
 
627 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  35.12 
 
 
627 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.39 
 
 
596 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  31.11 
 
 
503 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0142  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1714  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.125991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1820  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102915  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0584  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0976  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.307448  normal  0.190974 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0812  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.158231  hitchhiker  0.0000219513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1901  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2185  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2426  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0624  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2067  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121404  normal  0.0104805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2652  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1923  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.5 
 
 
661 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1387  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.017267  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2778  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.12 
 
 
475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  36 
 
 
553 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0690  RNA-directed DNA polymerase  33.04 
 
 
626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0722  RNA-directed DNA polymerase  33.04 
 
 
626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3163  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.27 
 
 
420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1421  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.37 
 
 
420 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1201  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.37 
 
 
420 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2085  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.37 
 
 
420 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  33.85 
 
 
549 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.71 
 
 
548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  32.76 
 
 
602 aa  164  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4498  RNA-directed DNA polymerase  30.31 
 
 
504 aa  163  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1255  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.73 
 
 
472 aa  163  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1035  hypothetical protein  31.47 
 
 
482 aa  163  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1253  hypothetical protein  31.47 
 
 
482 aa  163  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1977  hypothetical protein  31.47 
 
 
482 aa  163  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.71 
 
 
548 aa  163  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.71 
 
 
548 aa  163  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  35.71 
 
 
548 aa  163  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>