More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2957 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  100 
 
 		 125 aa  253  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  83.2 
 
 		 125 aa  206  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  68.8 
 
 		 125 aa  181  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  70.59 
 
 		 125 aa  175  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  59.68 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  56 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1087  Thioredoxin domain protein  58.43 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.826113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1025  thioredoxin-related  50.83 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  46.28 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2781  thioredoxin  56.32 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.528601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3645  thioredoxin domain-containing protein  53.41 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.890766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3604  thioredoxin domain-containing protein  47.42 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  47.83 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4016  thioredoxin domain protein  54.65 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4059  thioredoxin domain-containing protein  47.62 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.653805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  42.71 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1217  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 179 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  40 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  39.58 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  38.3 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  35.11 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  36.17 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  39.39 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  38.14 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  38.14 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  37.89 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  32.65 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  39.8 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  33.7 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  36.08 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  38.3 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  36.89 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  35.87 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  34.04 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  40.43 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  38.3 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  35.87 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  36 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  30.93 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  39.51 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  40.48 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  35.96 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  37.5 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0173  hypothetical protein  43.42 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  29.91 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  40.91 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  37.33 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  39.22 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  33.33 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  36.36 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  33.71 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  36.99 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  34.78 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  33.7 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  30.93 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  40.74 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  37.5 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  34.78 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  39.58 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  38.24 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  37.63 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  35.48 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  38.24 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  44.78 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  40 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  31.91 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  31.91 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  34.65 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  34.09 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  43.24 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  36.78 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  35 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  37.65 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  32.94 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  30.3 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  35.11 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  35.11 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  35.8 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>