More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1115 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1115  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 306 aa  624  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3146  ribosome small subunit-dependent GTPase A  94.79 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.79305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2074  ribosome small subunit-dependent GTPase A  61.64 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  39.52 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  38.7 
 
 		 344 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  37.84 
 
 		 343 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  38.05 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  39.39 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  39.53 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  37.21 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  39.53 
 
 		 334 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  39.53 
 
 		 339 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.88 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  37.37 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.88 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.88 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  31.63 
 
 		 354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  31.63 
 
 		 354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  40.91 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  31.63 
 
 		 340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  31.63 
 
 		 354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.23 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  32.26 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  35.79 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 351 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  41.81 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  35.45 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  32.9 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  32.9 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.79 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  32.58 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  31.51 
 
 		 352 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  37.23 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  38.8 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  32.57 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 		 350 aa  159  8e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  31.31 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.25 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  31.61 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  32.26 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  36.43 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  33.96 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  36.4 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  33.76 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  34.52 
 
 		 351 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  35.2 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  32.24 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  32.8 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  32.79 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.59 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  32.59 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  32.59 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  32.59 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  32.59 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  32.59 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  32.59 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  32.59 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.49 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  32.93 
 
 		 354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  32.62 
 
 		 372 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  31.95 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1850  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.99 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.055373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  38.19 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  32.57 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  35.06 
 
 		 353 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 346 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.42 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  31.95 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  31.95 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  31.95 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  31.95 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  32.78 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0776  ribosome-associated GTPase  35.84 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.91 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  31.63 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.24 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  38.25 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2668  hypothetical protein  31.67 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.07 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  38.25 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.07 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  36.43 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  38.25 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  36.43 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  34.87 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  36.43 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  37.85 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.39 
 
 		 319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2799  hypothetical protein  30.77 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  35.96 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.16 
 
 		 288 aa  139  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  32.55 
 
 		 351 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  37.79 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.98 
 
 		 293 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>