More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1850 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1850  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.055373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  44.03 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  39.39 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  39.77 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  39.02 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  39.02 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  40.46 
 
 		 343 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  34.88 
 
 		 372 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1568  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.15 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  35.22 
 
 		 354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  37.17 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  34.97 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  38.17 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  34.56 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  32.9 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  35.67 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  33.55 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  35.33 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.98 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  35.64 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  41.16 
 
 		 299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  34.78 
 
 		 347 aa  155  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  35.88 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.88 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  35.88 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  35.88 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  35.29 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  35.88 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  35.29 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  35.88 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  35.29 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  35.88 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  35.88 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  38.63 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  37.75 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  37.12 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1035  ribosome-associated GTPase  37.54 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  33.98 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  37.54 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  39.34 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0597  ribosome-associated GTPase  37.54 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1076  ribosome-associated GTPase  37.54 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  35.35 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 		 354 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  35.35 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  35.35 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  37.2 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  37.2 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2227  ribosome-associated GTPase  36.86 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  34.56 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0237  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1115  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.99 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0394  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3146  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.27 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.79305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  31.17 
 
 		 342 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2537  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 		 352 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0910  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  34.82 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.85 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.85 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  34.23 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.85 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.85 
 
 		 354 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  34.23 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  33.12 
 
 		 353 aa  143  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.12 
 
 		 346 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1668  ribosome-associated GTPase  37.2 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34029  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2910  ribosome-associated GTPase  36.86 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  33.33 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2850  ribosome-associated GTPase  36.86 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2960  ribosome-associated GTPase  36.86 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804771  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0711  GTPase EngC  36.76 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.197217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  33.55 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2074  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.5 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  32.25 
 
 		 354 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.57 
 
 		 355 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.92 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2799  hypothetical protein  32.88 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2668  hypothetical protein  32.88 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  32.47 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  36.24 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1842  GTPase EngC  33.86 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  38.98 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  34.81 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.33 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  35.09 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0347  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 		 358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0044619  unclonable  0.00000256254 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3754  ribosome-associated GTPase  33.22 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  34.02 
 
 		 349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>