69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0822 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  100 
 
 		 326 aa  675    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  70.55 
 
 		 326 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  68.1 
 
 		 326 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  51.56 
 
 		 374 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  39.54 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  37.42 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  29.56 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  26.53 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  35.51 
 
 		 496 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  37.8 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  26.07 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  25.66 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  25.66 
 
 		 290 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  40.87 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  28.72 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  26.23 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  25.99 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  39.5 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  24.76 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  24.83 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  37.61 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  36.29 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  26.45 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  23.78 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  25.08 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  31.52 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  24.2 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  32.19 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  41.33 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  26.47 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1794  hypothetical protein  69.49 
 
 		 84 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  43.75 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  29.31 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  37.5 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  36.46 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  28.1 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  25.61 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  29.82 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  35.14 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  29.25 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  31.09 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  28.69 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  36.59 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  32.48 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  27.61 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  36.27 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  23.6 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  27.47 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  37.93 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  37.93 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  32.48 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  37.31 
 
 		 231 aa  49.7  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  25.63 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  22.7 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  36.49 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  31.73 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  31.78 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  32.93 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  28.81 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  28.57 
 
 		 314 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  28.57 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  24.62 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  31.71 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3973  hypothetical protein  27.01 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  29.41 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  30.88 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  34.33 
 
 		 266 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>