39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0286 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  100 
 
 		 330 aa  678    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  93.27 
 
 		 334 aa  628  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  70.61 
 
 		 339 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0087  amidohydrolase 2  65.29 
 
 		 334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655536  hitchhiker  0.0000125986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  62.54 
 
 		 329 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3030  hypothetical protein  62.15 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.911136  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2775  hypothetical protein  58.36 
 
 		 330 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.03615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0537  amidohydrolase 2  35.42 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  32.59 
 
 		 415 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0887  putative mannonate dehydratase  27.1 
 
 		 327 aa  102  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  23.87 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  25.2 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  27.56 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 282 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  23.93 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.12 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  28.31 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  22.93 
 
 		 293 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  23.26 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  24.18 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  24.88 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  27.73 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  24.62 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  23.94 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  23.9 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  25.13 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 373 aa  42.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>