More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6845 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6845  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
398 aa  820    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.8 
 
 
383 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.68 
 
 
396 aa  205  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6236  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.08 
 
 
392 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  34.25 
 
 
365 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.48 
 
 
392 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4910  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.07 
 
 
390 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.96 
 
 
394 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4273  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.48 
 
 
356 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  31.47 
 
 
401 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.47 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  26.63 
 
 
384 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  25.41 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.36 
 
 
385 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.4 
 
 
358 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.21 
 
 
384 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  25.65 
 
 
393 aa  102  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  27.43 
 
 
387 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.9 
 
 
401 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  34.41 
 
 
429 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  34.41 
 
 
429 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  33.33 
 
 
414 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  34.03 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.24 
 
 
383 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  30.54 
 
 
427 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4605  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.26 
 
 
439 aa  96.7  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.5 
 
 
432 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 
423 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.23 
 
 
429 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.03 
 
 
430 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
430 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.96 
 
 
382 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
423 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.33 
 
 
406 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  32.2 
 
 
382 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0488  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.83 
 
 
455 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  28 
 
 
427 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.43 
 
 
447 aa  94  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32160  anthranilate dioxygenase large subunit  28.81 
 
 
464 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2725  anthranilate 1,2-dioxygenase, large subunit  29.03 
 
 
464 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5626  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.83 
 
 
458 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.32 
 
 
429 aa  93.2  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.15 
 
 
427 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.15 
 
 
427 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.56 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.575491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0662  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.32 
 
 
455 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  33.87 
 
 
445 aa  93.2  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001292  phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases large terminal subunit  24.18 
 
 
395 aa  92.8  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.99509  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0567  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.32 
 
 
458 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.23 
 
 
429 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2237  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.32 
 
 
458 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  29.38 
 
 
387 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.94 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.99 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.44 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.47 
 
 
427 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.51 
 
 
430 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  25.9 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.44 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.72 
 
 
362 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.58 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
430 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.37 
 
 
424 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2770  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.44 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0200185  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  34.64 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2260  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.79 
 
 
448 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 
376 aa  90.1  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.65 
 
 
448 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28 
 
 
355 aa  89.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1617  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.82 
 
 
455 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541424  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.46 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  32.8 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0563  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  35.8 
 
 
444 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1642  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.82 
 
 
455 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0658  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0492  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617282  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.39 
 
 
384 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5630  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1668  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.82 
 
 
455 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779225  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.546967  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1646  Rieske (2Fe-2S) region  29.67 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.03 
 
 
497 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471832  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0797  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.15 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  27.57 
 
 
434 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.61 
 
 
430 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  31.48 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
436 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2752  putative terephthalate 1,2-dioxygenase, large subunit (TphA1)  28.82 
 
 
418 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
431 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0533  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.66 
 
 
471 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37570  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  28.52 
 
 
424 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.925134  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.72 
 
 
398 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.16 
 
 
438 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1680  Rieske (2Fe-2S) region  32.16 
 
 
438 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.21 
 
 
414 aa  86.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>