More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6500 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 496 aa  966    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  72.54 
 
 		 460 aa  623  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  67.96 
 
 		 410 aa  527  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  66.67 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  59.14 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  59.37 
 
 		 416 aa  481  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  60.22 
 
 		 421 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  60.22 
 
 		 421 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  60.43 
 
 		 421 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  57.91 
 
 		 437 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  61.25 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  57.11 
 
 		 411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  56.55 
 
 		 422 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  55.37 
 
 		 415 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  52.42 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  54.61 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  52.95 
 
 		 402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  53.91 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  66.67 
 
 		 333 aa  330  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  71.55 
 
 		 266 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  72.37 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  51.5 
 
 		 389 aa  256  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  53.36 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  56.48 
 
 		 326 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  51.54 
 
 		 238 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  41.38 
 
 		 237 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  42 
 
 		 239 aa  146  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  38.3 
 
 		 574 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  39.19 
 
 		 238 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  40.74 
 
 		 606 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  37.75 
 
 		 238 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  39.44 
 
 		 613 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 		 238 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 255 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 273 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 289 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  31.51 
 
 		 253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2556  GtrA family protein  48.44 
 
 		 168 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  37.73 
 
 		 243 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 380 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 		 267 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 256 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  32 
 
 		 259 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 		 245 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 237 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 238 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  39.39 
 
 		 163 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 272 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 256 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 273 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 276 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 267 aa  97.1  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 261 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 236 aa  94.7  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 262 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  37.5 
 
 		 248 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 231 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 		 271 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  29.02 
 
 		 325 aa  89.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 		 263 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 394 aa  88.6  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.68 
 
 		 305 aa  87.4  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.89 
 
 		 248 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 		 232 aa  86.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.58 
 
 		 247 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.08 
 
 		 780 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  35.58 
 
 		 883 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.73 
 
 		 809 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2486  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.98 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.39 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.62 
 
 		 252 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  37.32 
 
 		 257 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.69 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.07 
 
 		 264 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.26 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 262 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3413  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  29.11 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.92 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 340 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 246 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 		 341 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 235 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  28.16 
 
 		 236 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  32.79 
 
 		 264 aa  79.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  32.69 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  28.91 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  31.96 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  31.51 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>