More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5490 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5490  putative cytochrome P450  100 
 
 
437 aa  863    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0347822  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4812  cytochrome P450-family protein  52.43 
 
 
446 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2803  putative cytochrome P450-family protein  49.36 
 
 
414 aa  388  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348302  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1142  putative cytochrome P450  51.99 
 
 
421 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15529  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2751  putative cytochrome P450-family protein  45 
 
 
426 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.581871  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5491  putative cytochrome P450  48.3 
 
 
488 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767325  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4334  putative cytochrome P450  39.8 
 
 
484 aa  278  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33530  cytochrome P450  36.32 
 
 
410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101916  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4583  putative cytochrome P450  36.2 
 
 
471 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2975  putative cytochrome P450  32.43 
 
 
452 aa  201  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1747  putative cytochrome P450  33.25 
 
 
454 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0264528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4184  cytochrome P450 monooxygenase  34.34 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1685  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1433  Cytochrome P450-like protein  30.77 
 
 
424 aa  176  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.667112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2597  Cytochrome P450  34.91 
 
 
500 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4420  putative cytochrome P450  33.85 
 
 
440 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4556  putative cytochrome P450  29.98 
 
 
442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3959  Cytochrome P450-like protein  29.45 
 
 
465 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  29.31 
 
 
412 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  24.26 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  24.26 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  25.3 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  28.02 
 
 
424 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  29.09 
 
 
426 aa  126  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  24.02 
 
 
411 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  24.02 
 
 
411 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  23.67 
 
 
411 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  23.77 
 
 
411 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  29.78 
 
 
411 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  23.04 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  27.12 
 
 
405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  23.43 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  25.12 
 
 
411 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  28.46 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  29.12 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  22.79 
 
 
411 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  22.6 
 
 
411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  27.39 
 
 
400 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  26.82 
 
 
417 aa  116  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  26.27 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  26.87 
 
 
409 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  28.35 
 
 
409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  28.04 
 
 
423 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  31.27 
 
 
436 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  28.54 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  27.23 
 
 
416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  27.87 
 
 
422 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  26.39 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  29.72 
 
 
420 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  28.27 
 
 
388 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  28.73 
 
 
408 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  31.63 
 
 
399 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  28.1 
 
 
409 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  26.91 
 
 
395 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  26.97 
 
 
401 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  25.85 
 
 
408 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  27.39 
 
 
418 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7442  Cytochrome P450-like protein  30.61 
 
 
571 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  27.95 
 
 
366 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  22.83 
 
 
410 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  25.06 
 
 
414 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  27.13 
 
 
398 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  25.3 
 
 
419 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1257  cytochrome P450 monooxygenase  27.54 
 
 
396 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  22.74 
 
 
411 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  28.24 
 
 
400 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  27.11 
 
 
399 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  27.9 
 
 
432 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  30.03 
 
 
399 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  26.95 
 
 
400 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  27.78 
 
 
401 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  27.8 
 
 
412 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  26.65 
 
 
400 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  27.88 
 
 
410 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  29.17 
 
 
395 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  26.57 
 
 
400 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  26.15 
 
 
402 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  29.06 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  27.59 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  28.08 
 
 
406 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  26.99 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  27.51 
 
 
367 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  25.57 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  29.72 
 
 
439 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3894  cytochrome P450  27.88 
 
 
403 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  26.42 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  27.08 
 
 
398 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  29.8 
 
 
410 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  28.31 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  26.75 
 
 
395 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  29.75 
 
 
410 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  28.53 
 
 
357 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  29.63 
 
 
436 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  29.15 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  27.32 
 
 
414 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  27.53 
 
 
400 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  28.2 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  28.35 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  28.9 
 
 
430 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  27.33 
 
 
401 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  28.02 
 
 
415 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>