More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4585 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  100 
 
 
399 aa  818    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  54.92 
 
 
397 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  51.03 
 
 
390 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  46.92 
 
 
401 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  41.43 
 
 
421 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  38.56 
 
 
399 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  38.85 
 
 
399 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  38.02 
 
 
403 aa  260  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  38.16 
 
 
399 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  38.1 
 
 
398 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  38.5 
 
 
398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11815  cytochrome P450 143 cyp143  39.14 
 
 
393 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.581255  normal  0.84811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  35.45 
 
 
425 aa  226  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  34.84 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  38 
 
 
418 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  34.48 
 
 
387 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3682  cytochrome P450  36.29 
 
 
410 aa  209  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0514  cytochrome P450  34.06 
 
 
421 aa  209  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  35.49 
 
 
412 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  35.26 
 
 
390 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4803  cytochrome P450  33.78 
 
 
394 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173439  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4028  cytochrome P450  38.37 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4160  cytochrome P450  34.86 
 
 
385 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  31.2 
 
 
406 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4422  cytochrome P450  33.51 
 
 
394 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4509  cytochrome P450  33.51 
 
 
394 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  32.26 
 
 
461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2249  cytochrome P450  33.16 
 
 
396 aa  196  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.274245  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0872  cytochrome P450  34.01 
 
 
397 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  34.05 
 
 
407 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  33.08 
 
 
392 aa  189  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1478  cytochrome P450  30.99 
 
 
417 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  33.97 
 
 
426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  35.01 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  32.05 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  33.75 
 
 
395 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.89 
 
 
409 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  32.13 
 
 
398 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32 
 
 
398 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  34.36 
 
 
406 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31.32 
 
 
388 aa  179  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  33.51 
 
 
405 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  31.35 
 
 
412 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  31.33 
 
 
424 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.15 
 
 
407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  29.74 
 
 
411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  31.7 
 
 
418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  31.4 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.02 
 
 
420 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  30.85 
 
 
394 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  31.4 
 
 
406 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1743  cytochrome P450  30.73 
 
 
409 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  32.97 
 
 
395 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  32.67 
 
 
398 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  30.56 
 
 
402 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  32.45 
 
 
404 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  31.59 
 
 
412 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  32.72 
 
 
404 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  31.75 
 
 
395 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  32.72 
 
 
404 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  30.98 
 
 
398 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  32.59 
 
 
405 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  30.03 
 
 
449 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  32.72 
 
 
404 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  32.3 
 
 
406 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  32.33 
 
 
405 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.68 
 
 
408 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.25 
 
 
380 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  33.43 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  30.89 
 
 
412 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  30.41 
 
 
447 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  32.03 
 
 
422 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  32 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  30.25 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  31.09 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  31.56 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  30.75 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  32.44 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  30.75 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  33.51 
 
 
774 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  30.75 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  32.68 
 
 
396 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  30.21 
 
 
404 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  29.76 
 
 
403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  30.21 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  35.84 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  31.47 
 
 
427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  30.21 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  33.33 
 
 
398 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  31.54 
 
 
406 aa  163  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  33.33 
 
 
398 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  31.07 
 
 
403 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  30.95 
 
 
425 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  31.96 
 
 
390 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  31.68 
 
 
406 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.21 
 
 
417 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  30.15 
 
 
418 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  29.4 
 
 
412 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  33.05 
 
 
398 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  29.2 
 
 
433 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>