More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3715 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3698  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  95.07 
 
 		 568 aa  1117    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3715  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 		 568 aa  1162    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4396  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  75.83 
 
 		 571 aa  900    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1796  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  74.61 
 
 		 571 aa  890    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4777  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  75.83 
 
 		 571 aa  900    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4483  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  75.83 
 
 		 571 aa  900    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  73.2 
 
 		 573 aa  874    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  29.44 
 
 		 547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  29.08 
 
 		 547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  28.8 
 
 		 547 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  28.8 
 
 		 547 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  28.8 
 
 		 547 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  28.62 
 
 		 547 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  28.62 
 
 		 547 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  28.62 
 
 		 547 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  28.72 
 
 		 547 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  28.27 
 
 		 547 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3306  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.16 
 
 		 588 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 557 aa  207  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.83 
 
 		 568 aa  203  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  29.59 
 
 		 590 aa  200  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.13 
 
 		 581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  29.24 
 
 		 847 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  28.22 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  30.02 
 
 		 562 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  30.02 
 
 		 562 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  30.02 
 
 		 562 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  30.02 
 
 		 565 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  29.91 
 
 		 565 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  29.84 
 
 		 565 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  29.73 
 
 		 562 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  30.02 
 
 		 562 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  29.84 
 
 		 562 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  28.08 
 
 		 847 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.3 
 
 		 569 aa  188  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.39 
 
 		 640 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  28.99 
 
 		 562 aa  187  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  29.25 
 
 		 550 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  27.16 
 
 		 547 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.51 
 
 		 581 aa  186  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.56 
 
 		 577 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  26.25 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  27.05 
 
 		 599 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  27.53 
 
 		 548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2800  putative oxalyl-CoA decarboxylase  28.04 
 
 		 576 aa  183  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  25.85 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  26.73 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  27.81 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  29.41 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  26.44 
 
 		 546 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1149  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.98 
 
 		 584 aa  182  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314848  normal  0.637283 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  27.69 
 
 		 587 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  26.88 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.55 
 
 		 584 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.05 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  26.08 
 
 		 546 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  26.08 
 
 		 546 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  26.08 
 
 		 546 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  28.47 
 
 		 560 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  25.72 
 
 		 546 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.6 
 
 		 546 aa  180  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  25.31 
 
 		 576 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  25.85 
 
 		 550 aa  180  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.89 
 
 		 579 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  25.36 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  25.54 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  25.93 
 
 		 546 aa  179  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  25.49 
 
 		 598 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1209  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.16 
 
 		 583 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1369  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.16 
 
 		 583 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  27.26 
 
 		 550 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  26.98 
 
 		 587 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  25.26 
 
 		 546 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  25.26 
 
 		 546 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  25.26 
 
 		 546 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  25.26 
 
 		 546 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  27.43 
 
 		 587 aa  176  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  25.26 
 
 		 546 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  25.26 
 
 		 546 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  25.26 
 
 		 546 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  25.26 
 
 		 546 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.86 
 
 		 588 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  26.81 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  28.1 
 
 		 558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  26.77 
 
 		 580 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.01 
 
 		 566 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  25.99 
 
 		 547 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3317  acetolactate synthase  28.04 
 
 		 559 aa  174  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  27.5 
 
 		 582 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  27.31 
 
 		 583 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  27.52 
 
 		 547 aa  174  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4487  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.5 
 
 		 609 aa  173  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.21 
 
 		 554 aa  173  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26 
 
 		 581 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6740  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.3 
 
 		 580 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.766112 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.09 
 
 		 579 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  27.41 
 
 		 570 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.11 
 
 		 607 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.47 
 
 		 557 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3439  acetolactate synthase  27.42 
 
 		 559 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>