More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3306 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3306  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
588 aa  1185    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  34.57 
 
 
550 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.23 
 
 
554 aa  225  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3698  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.28 
 
 
568 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.28 
 
 
568 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  30.82 
 
 
847 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3715  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.06 
 
 
568 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.87 
 
 
568 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1796  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  30.55 
 
 
571 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  30.42 
 
 
847 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  30.32 
 
 
611 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.84 
 
 
557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  28.18 
 
 
640 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4777  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  29.66 
 
 
571 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4396  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  29.66 
 
 
571 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4483  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.66 
 
 
571 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714165  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.34 
 
 
552 aa  212  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.97 
 
 
573 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.96 
 
 
566 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.17 
 
 
562 aa  210  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.32 
 
 
566 aa  209  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8567  thiamine pyrophosphate protein central region  30.48 
 
 
596 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450993  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.03 
 
 
582 aa  207  6e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.35 
 
 
578 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1020  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.04 
 
 
565 aa  204  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.05 
 
 
557 aa  204  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.07 
 
 
588 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  28.06 
 
 
550 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2293  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  31.19 
 
 
570 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2340  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.19 
 
 
570 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.425304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0790  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.21 
 
 
564 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000243733  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.42 
 
 
580 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2332  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.19 
 
 
588 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428788  normal  0.0160517 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.96 
 
 
557 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.87 
 
 
562 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.86 
 
 
566 aa  199  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  27.79 
 
 
623 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.58 
 
 
557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  27.19 
 
 
567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  27.57 
 
 
566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.72 
 
 
558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.44 
 
 
566 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  26.32 
 
 
545 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.64 
 
 
569 aa  197  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  29.29 
 
 
622 aa  198  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.69 
 
 
561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3099  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  31.37 
 
 
579 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.67 
 
 
563 aa  196  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  27.5 
 
 
556 aa  196  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  26.19 
 
 
587 aa  196  9e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.2 
 
 
556 aa  196  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.42 
 
 
574 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  29.47 
 
 
582 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.05 
 
 
552 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  27.16 
 
 
555 aa  196  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.16 
 
 
584 aa  195  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  27.8 
 
 
562 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.23 
 
 
553 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  26.58 
 
 
547 aa  194  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.68 
 
 
561 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.85 
 
 
566 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.9 
 
 
597 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  26.09 
 
 
550 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  25.72 
 
 
566 aa  194  6e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  26.09 
 
 
550 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  31.23 
 
 
576 aa  193  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.74 
 
 
559 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2652  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.55 
 
 
586 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.51 
 
 
566 aa  192  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  32.52 
 
 
535 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  27.68 
 
 
542 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.41 
 
 
572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  30.66 
 
 
578 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.77 
 
 
627 aa  191  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.42 
 
 
564 aa  191  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.2 
 
 
573 aa  190  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.78 
 
 
574 aa  190  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  27.82 
 
 
566 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27 
 
 
563 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.92 
 
 
554 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.19 
 
 
565 aa  189  9e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.62 
 
 
593 aa  189  9e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.53 
 
 
555 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  28.77 
 
 
599 aa  189  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  25.67 
 
 
587 aa  189  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.13 
 
 
629 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.96 
 
 
573 aa  189  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  30.05 
 
 
598 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.59 
 
 
571 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.01 
 
 
566 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  27.81 
 
 
546 aa  188  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  25.13 
 
 
547 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1406  acetolactate synthase, large subunit  29.22 
 
 
563 aa  188  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0875131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4634  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  29.21 
 
 
581 aa  188  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123329  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.26 
 
 
563 aa  187  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3640  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.22 
 
 
608 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  31.9 
 
 
535 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.2 
 
 
623 aa  187  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  30.34 
 
 
590 aa  187  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.59 
 
 
566 aa  187  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>