More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3205 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3205  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  100 
 
 
394 aa  786    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.901483  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0776  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  72.56 
 
 
393 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1029  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  72.02 
 
 
397 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.918253  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1002  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  72.02 
 
 
397 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1019  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  72.02 
 
 
397 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26668  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2361  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  70.08 
 
 
393 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10708  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD1  71.32 
 
 
396 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1297  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  69.77 
 
 
391 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0902031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5059  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  70.98 
 
 
391 aa  531  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3151  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  68.02 
 
 
400 aa  523  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0698274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3777  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  63.31 
 
 
407 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0573  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  66.49 
 
 
389 aa  494  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2980  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  61.64 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17191  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent)-like alpha-hydroxy acid dehydrogenases  36.69 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  35.42 
 
 
381 aa  237  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2829  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.36 
 
 
388 aa  233  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.41 
 
 
406 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.13 
 
 
386 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2545  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.16 
 
 
381 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3514  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.83 
 
 
381 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.98 
 
 
391 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  36.79 
 
 
383 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  36.53 
 
 
383 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.96 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3713  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.04 
 
 
382 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.628377 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0360  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.95 
 
 
370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0085  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.11 
 
 
382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0068  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.76 
 
 
382 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368436  normal  0.0189918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4852  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.89 
 
 
440 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00125514  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.42 
 
 
387 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.91 
 
 
405 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.81 
 
 
381 aa  216  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.08 
 
 
387 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  35.08 
 
 
387 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2488  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.45 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0763521  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5250  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.29 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3333  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.29 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0889608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5034  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.29 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.95 
 
 
381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.2 
 
 
390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2999  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.58 
 
 
366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.2 
 
 
390 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.14 
 
 
409 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.4 
 
 
380 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.99 
 
 
383 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  34.11 
 
 
390 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  34.83 
 
 
397 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.86 
 
 
385 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.81 
 
 
390 aa  207  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.34 
 
 
379 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5294  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.29 
 
 
391 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.93 
 
 
397 aa  206  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03020  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  36.88 
 
 
409 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  34.41 
 
 
381 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  34.41 
 
 
381 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.45 
 
 
359 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.97 
 
 
378 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0219  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.77 
 
 
387 aa  203  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.25 
 
 
387 aa  203  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.75 
 
 
383 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1846  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.21 
 
 
382 aa  203  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50804  glycolate oxidase  35.64 
 
 
431 aa  203  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114627  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1172  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  34.64 
 
 
394 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1619  Lactate 2-monooxygenase  37.76 
 
 
389 aa  202  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00855428  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.14 
 
 
380 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.75 
 
 
403 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.02 
 
 
381 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.11 
 
 
387 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  34.32 
 
 
386 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.22 
 
 
379 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.7 
 
 
378 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20471  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) and related alpha-hydroxy acid dehydrogenases  34.38 
 
 
398 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.819941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5297  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.34 
 
 
422 aa  199  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.89 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2117  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.17 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.32 
 
 
402 aa  197  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.32 
 
 
402 aa  197  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5475  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.02 
 
 
396 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0758  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.17 
 
 
417 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  34.57 
 
 
394 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3343  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.29 
 
 
417 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0789  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.48 
 
 
431 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.77 
 
 
401 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0107  putative FMN-dependent dehydrogenase  35.98 
 
 
420 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1041  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.6 
 
 
458 aa  193  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1074  Lactate 2-monooxygenase  38.83 
 
 
393 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2407  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.46 
 
 
406 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463668  normal  0.0231198 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  34.23 
 
 
386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.72 
 
 
381 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3141  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35 
 
 
410 aa  190  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.36 
 
 
379 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  34.14 
 
 
392 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2038  FMN-dependent family dehydrogenase  35.7 
 
 
441 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1565  FMN-dependent family dehydrogenase  35.98 
 
 
407 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2112  FMN-dependent family dehydrogenase  35.7 
 
 
447 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0908  L-lactate dehydrogenase  32.89 
 
 
380 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0717  FMN-dependent family dehydrogenase  35.7 
 
 
447 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11900  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD2  34.81 
 
 
414 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.877385 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2199  FMN-dependent family dehydrogenase  35.7 
 
 
441 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>