More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2431 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  100 
 
 
148 aa  298  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3983  NUDIX hydrolase  54.68 
 
 
161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189936  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5627  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
156 aa  107  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0133288  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  37.68 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3433  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
300 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  38.27 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  37.04 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  35.8 
 
 
148 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  37.04 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  35.8 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  34.57 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2676  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870264  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  44.44 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  31.36 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  25.78 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2430  tellurite resistance TerB  28.41 
 
 
332 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  43.08 
 
 
137 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
182 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 
143 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
179 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  24.7 
 
 
168 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 
158 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0007  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.768142  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1826  phosphohydrolase  35.8 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  36 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3750  NUDIX hydrolase  25 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  25.4 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3516  phosphohydrolase  42.62 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 
183 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  25.56 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
172 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  35.21 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  45 
 
 
152 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
150 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  28.72 
 
 
171 aa  47.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  25.83 
 
 
184 aa  47  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
138 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1992  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  39.08 
 
 
375 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  45 
 
 
152 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  22.88 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  30 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  45.1 
 
 
160 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  32.65 
 
 
314 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
183 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  37.74 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1662  MutT/Nudix family protein  34.57 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.824241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  41.03 
 
 
329 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
158 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  52.73 
 
 
361 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1697  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0101183  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  34.62 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  22.03 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>