23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2430 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2430  tellurite resistance TerB  100 
 
 
332 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333717 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3433  NUDIX hydrolase  53.99 
 
 
300 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5626  putative tellurium resistance protein  40.57 
 
 
358 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1940  tellurite resistance TerB  44.44 
 
 
151 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3009  tellurite resistance TerB  43.75 
 
 
151 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380489  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3017  Tellurite resistance TerB  36.81 
 
 
151 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000389942  decreased coverage  0.0000328621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3770  Tellurite resistance TerB  39.26 
 
 
152 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1272  tellurite resistance TerB  37.3 
 
 
151 aa  95.9  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1001  tellurite resistance TerB  28.99 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.110378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09850  Tellurite resistance TerB  30.99 
 
 
149 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0942  tellurium resistance protein TerB  27.74 
 
 
149 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0810  tellurite resistance TerB  27.01 
 
 
149 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304003  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0272  tellurite resistance TerB  25.69 
 
 
149 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0891  tellurite resistance TerB  24.31 
 
 
150 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0058  tellurite resistance protein-like  37.5 
 
 
155 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3696  Tellurite resistance TerB  24.66 
 
 
151 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0390345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3787  tellurite resistance protein  24.09 
 
 
151 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000180248  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0664  tellurite resistance protein  24.09 
 
 
151 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000717053  normal  0.35704 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3875  tellurite resistance TerB  24.09 
 
 
151 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000149484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1352  TerB  23.24 
 
 
151 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  0.570611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 
148 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  28.31 
 
 
143 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2191  TerB  31.43 
 
 
143 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  hitchhiker  0.000000525485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>