105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1811 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  75.11 
 
 
440 aa  646    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
441 aa  903    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  49.66 
 
 
315 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  43.12 
 
 
345 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.65 
 
 
330 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.17 
 
 
356 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  38.79 
 
 
354 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.88 
 
 
359 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.95 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.81 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  40.85 
 
 
346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.45 
 
 
338 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  38.69 
 
 
358 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.24 
 
 
368 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.32 
 
 
364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.67 
 
 
343 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  41.28 
 
 
349 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  43.7 
 
 
370 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.4 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.37 
 
 
355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.57 
 
 
374 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.49 
 
 
399 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.59 
 
 
300 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.63 
 
 
361 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  37.99 
 
 
369 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.15 
 
 
361 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.71 
 
 
360 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  39.68 
 
 
365 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.53 
 
 
402 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.73 
 
 
406 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  30.92 
 
 
429 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  34.29 
 
 
414 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 
414 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 
414 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.08 
 
 
382 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.8 
 
 
370 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.43 
 
 
399 aa  162  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  34.22 
 
 
392 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.67 
 
 
233 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.67 
 
 
199 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.5 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  43.53 
 
 
207 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35 
 
 
206 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  39.33 
 
 
203 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  37.5 
 
 
192 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.15 
 
 
209 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.89 
 
 
210 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  29.73 
 
 
220 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.25 
 
 
214 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  37.62 
 
 
149 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  35.59 
 
 
141 aa  55.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  42.25 
 
 
205 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  41.27 
 
 
160 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  44.07 
 
 
159 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  43.64 
 
 
168 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  35.8 
 
 
168 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 
151 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.27 
 
 
179 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.67 
 
 
159 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1913  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.77 
 
 
184 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
159 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  38.33 
 
 
175 aa  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  40 
 
 
173 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  39.66 
 
 
163 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.26 
 
 
269 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.19 
 
 
130 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.83 
 
 
146 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.64 
 
 
175 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  37.5 
 
 
187 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.2 
 
 
239 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.23 
 
 
640 aa  47  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  44.29 
 
 
148 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.35 
 
 
178 aa  46.6  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
155 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.51 
 
 
135 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  44.07 
 
 
139 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  32.43 
 
 
172 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  36.23 
 
 
173 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  37.93 
 
 
165 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.62 
 
 
161 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  30.88 
 
 
178 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.82 
 
 
122 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06651  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.35 
 
 
178 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
207 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
204 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.48 
 
 
130 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.86 
 
 
148 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  43.1 
 
 
175 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04631  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  33.82 
 
 
178 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.48 
 
 
130 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.8 
 
 
195 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.8 
 
 
171 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1623  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  38.57 
 
 
187 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  33.85 
 
 
647 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.23 
 
 
130 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0943  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.29 
 
 
190 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.218843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  39.34 
 
 
139 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
199 aa  43.9  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2157  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.44 
 
 
182 aa  43.9  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00819561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>