More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3607 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.16 
 
 		 733 aa  781    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.09 
 
 		 736 aa  769    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.52 
 
 		 723 aa  705    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.41 
 
 		 747 aa  718    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.89 
 
 		 733 aa  788    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.92 
 
 		 781 aa  899    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.28 
 
 		 733 aa  761    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.78 
 
 		 747 aa  660    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.92 
 
 		 718 aa  805    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.53 
 
 		 746 aa  723    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.26 
 
 		 722 aa  770    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 739 aa  1447    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.58 
 
 		 760 aa  708    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.47 
 
 		 759 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.19 
 
 		 726 aa  701    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.93 
 
 		 758 aa  640    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.66 
 
 		 756 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.09 
 
 		 741 aa  676    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.41 
 
 		 749 aa  689    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.09 
 
 		 725 aa  722    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.53 
 
 		 757 aa  672    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.3 
 
 		 733 aa  729    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.61 
 
 		 748 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.64 
 
 		 750 aa  619  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.12 
 
 		 750 aa  616  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.65 
 
 		 752 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.89 
 
 		 741 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.89 
 
 		 741 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.63 
 
 		 741 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.63 
 
 		 753 aa  579  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.57 
 
 		 752 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  48.27 
 
 		 741 aa  566  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.54 
 
 		 737 aa  567  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.04 
 
 		 778 aa  541  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.7 
 
 		 730 aa  539  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  43.57 
 
 		 739 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.34 
 
 		 786 aa  445  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.72 
 
 		 818 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.28 
 
 		 720 aa  431  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.24 
 
 		 704 aa  430  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.39 
 
 		 683 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.02 
 
 		 772 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.23 
 
 		 685 aa  425  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.28 
 
 		 829 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.2 
 
 		 815 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.3 
 
 		 904 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.37 
 
 		 767 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.72 
 
 		 842 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.88 
 
 		 832 aa  415  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.94 
 
 		 778 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.18 
 
 		 740 aa  411  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  37.03 
 
 		 818 aa  412  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.34 
 
 		 689 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.64 
 
 		 846 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.92 
 
 		 846 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.13 
 
 		 682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.99 
 
 		 682 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.13 
 
 		 682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.45 
 
 		 680 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10000  RecG-like helicase  38.75 
 
 		 723 aa  409  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000812963  hitchhiker  0.000000704574 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.74 
 
 		 818 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.13 
 
 		 682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.13 
 
 		 682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.71 
 
 		 682 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.73 
 
 		 904 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.66 
 
 		 815 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.47 
 
 		 765 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.99 
 
 		 682 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.75 
 
 		 682 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.37 
 
 		 772 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.59 
 
 		 657 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.71 
 
 		 703 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.64 
 
 		 812 aa  405  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.07 
 
 		 817 aa  405  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.63 
 
 		 818 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  35.88 
 
 		 792 aa  405  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.3 
 
 		 819 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.16 
 
 		 842 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.67 
 
 		 712 aa  405  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.47 
 
 		 714 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.75 
 
 		 678 aa  402  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.35 
 
 		 682 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.94 
 
 		 685 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.3 
 
 		 819 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  33.79 
 
 		 700 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.44 
 
 		 682 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.2 
 
 		 681 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.12 
 
 		 779 aa  401  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.52 
 
 		 692 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.58 
 
 		 772 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.2 
 
 		 695 aa  397  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.54 
 
 		 818 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.94 
 
 		 694 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.07 
 
 		 818 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.29 
 
 		 862 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.73 
 
 		 799 aa  399  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.45 
 
 		 719 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0908  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.4 
 
 		 703 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.26 
 
 		 717 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.47 
 
 		 702 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>