More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1330 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1330  Acetyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 		 402 aa  811    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175377  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  81.07 
 
 		 407 aa  644    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3017  acetyl-CoA acetyltransferase  85.75 
 
 		 400 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5179  acetyl-CoA acetyltransferase  85.39 
 
 		 405 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.974685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  79.43 
 
 		 398 aa  632  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  79.69 
 
 		 398 aa  633  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6729  Acetyl-CoA C-acyltransferase  78.35 
 
 		 399 aa  629  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal  0.313674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1760  acetyl-CoA acetyltransferase  77.72 
 
 		 398 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  76.47 
 
 		 406 aa  623  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6777  acetyl-CoA acetyltransferase  76.01 
 
 		 404 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2267  acetyl-CoA acetyltransferase  77.58 
 
 		 394 aa  616  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0453724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3548  acetyl-CoA acetyltransferase  76.47 
 
 		 435 aa  615  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000428807  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  74.31 
 
 		 441 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  75.38 
 
 		 399 aa  610  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1648  acetyl-CoA acetyltransferase  74.69 
 
 		 431 aa  609  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  73.12 
 
 		 416 aa  598  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0190156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1903  thiolase  78.55 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0201769  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  76.08 
 
 		 443 aa  596  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2379  acetyl-CoA acetyltransferase  73.98 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16370  acetyl-CoA acetyltransferase  70.45 
 
 		 414 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  73.59 
 
 		 413 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1961  acetyl-CoA acetyltransferase  70.41 
 
 		 405 aa  552  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141974  hitchhiker  0.000049161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3502  acetyl-CoA acetyltransferase  71.9 
 
 		 403 aa  551  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  65.63 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.908715  normal  0.564099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1403  acetyl-CoA acetyltransferases  59.64 
 
 		 397 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  41.06 
 
 		 400 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.86 
 
 		 402 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.64 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  42.47 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.85 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.46 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.9 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.11 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 		 403 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  41.35 
 
 		 398 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.95 
 
 		 387 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.86 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.86 
 
 		 401 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.86 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.25 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.79 
 
 		 387 aa  275  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  40.9 
 
 		 399 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  41.1 
 
 		 398 aa  275  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.05 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  40.59 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.64 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.12 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  41.55 
 
 		 411 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.12 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.15 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.56 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.4 
 
 		 406 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.8 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.04 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  41.25 
 
 		 399 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.17 
 
 		 402 aa  269  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.66 
 
 		 387 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.18 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2813  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.96 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.18 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.18 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.87 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0810  acetyl-CoA acetyltransferase  38.99 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.65 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  38.66 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.02 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  39.49 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  35.98 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  38.66 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.55 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.85 
 
 		 400 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.13 
 
 		 401 aa  266  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2398  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.71 
 
 		 404 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.05 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.61 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.96 
 
 		 400 aa  265  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.5 
 
 		 401 aa  265  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3817  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.89 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342628  normal  0.265145 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.09 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.87 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.44 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  42.34 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.6 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 		 399 aa  265  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.29 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.86 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.35 
 
 		 400 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.79 
 
 		 403 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.4 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.9 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1847  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.08 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.227996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.18 
 
 		 406 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.14 
 
 		 387 aa  263  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  41.85 
 
 		 412 aa  262  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.89 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.7 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.14 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.89 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  42.42 
 
 		 390 aa  262  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>