More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1310 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1310  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 396 aa  773    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.039712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2166  glycosyl transferase group 1  62.72 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4009  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 365 aa  166  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3264  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  22.73 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4421  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2730  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0220  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.51 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  23 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1694  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.07 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 		 856 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  29.17 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  28.48 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.48 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0632  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.24 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.4 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3893  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  42.5 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  25.48 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  31.79 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  33.46 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 1080 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  30.35 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  20.24 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  19.84 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  19.84 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.33 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  28.3 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  21.07 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  25.35 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  25.35 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  27.49 
 
 		 350 aa  53.5  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 		 374 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 376 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1808  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 416 aa  53.1  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 		 359 aa  53.1  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.89 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.35 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.06 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1083  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  28.51 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>