More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0161 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  100 
 
 		 289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  79.17 
 
 		 289 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  61.57 
 
 		 291 aa  330  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  48.15 
 
 		 291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  48.15 
 
 		 291 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  49.11 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  50.18 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  36.51 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  35.79 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  36.96 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  39.78 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  34.83 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.3 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  38.12 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40.83 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  33.47 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  38.94 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  33.45 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  31.92 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  34.93 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.99 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  35.85 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  36.13 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  36.13 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  36.97 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  38.33 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  37.91 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  37.91 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  32.58 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  37.67 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  38.38 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  37.36 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  34.1 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  30.6 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  38.1 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  32.05 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  35.98 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  31.2 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  32.49 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  32.13 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  32.13 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  32.13 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8767  hypothetical protein  35.71 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.18 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.9 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  34.1 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.8 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  30.82 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.55 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  35.12 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  32.46 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  31.97 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  31.3 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  33.52 
 
 		 346 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  34.87 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  34.25 
 
 		 353 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  37.63 
 
 		 278 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  31.38 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  30.08 
 
 		 284 aa  95.5  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  32.64 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  38.82 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1265  luciferase-like protein  32.81 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  34.22 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  32.74 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  30.98 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  28.96 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  31.19 
 
 		 337 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  30.34 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  33.87 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  33.61 
 
 		 308 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  32.52 
 
 		 334 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  31.98 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5018  luciferase-like protein  33.61 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.915726  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.21 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  33.2 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  31.88 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  33.2 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  31.88 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  34.13 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  33.98 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  33.48 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  29.96 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3246  luciferase family protein  33.19 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.05728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  32.55 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  33.78 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  28.86 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  38.3 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1465  luciferase family protein  35.96 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  34.88 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2879  luciferase-like  36.22 
 
 		 364 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.119535  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  34.24 
 
 		 326 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  31.7 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  28.63 
 
 		 387 aa  86.7  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  31.77 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 		 329 aa  85.9  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  35.71 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>