More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0447 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  610  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  44 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  36.77 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  35.69 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  34.31 
 
 		 315 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  27.36 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  31.16 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.41 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  28.86 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  27.42 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  27.15 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.09 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.09 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  27.09 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  29.11 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  29.93 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  28.89 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.76 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  31.73 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  31.73 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  31.73 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  30.11 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 		 380 aa  99  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  27.24 
 
 		 317 aa  99  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  27.78 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  26.94 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  31.37 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  25.91 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  27.36 
 
 		 324 aa  96.3  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  29.06 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  29.6 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  26.02 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 316 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  28.33 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  26.05 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  26.05 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  26.98 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.64 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  29.75 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  25.93 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  26.21 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.41 
 
 		 323 aa  92.8  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  25.75 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  30.3 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  30.63 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  26.19 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  25.42 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  32.23 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  26.49 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.54 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  24.17 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  28.23 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  25.42 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  25.95 
 
 		 355 aa  89.7  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  29.56 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  26.24 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  25.67 
 
 		 327 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  26.3 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  25.38 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  27.34 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  31.73 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  28.63 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  30.77 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  25 
 
 		 312 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  27.45 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  25.17 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  28.96 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  28.96 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  30.04 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  27.78 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  26.14 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  26.26 
 
 		 329 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  28.09 
 
 		 319 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.54 
 
 		 325 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  27.85 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  25.59 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.62 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  26.79 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.24 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  25.9 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  28.41 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  24.74 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  30.26 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  28.99 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  24.91 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.78 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.4 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  25.9 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  28.1 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.9 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>