More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3456 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3456  peptide chain release factor-like protein  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0652118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7272  peptide chain release factor-like protein  43.35 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000014386  normal  0.97905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0332  putative peptide chain release factor  40.83 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0268  peptide chain release factor-like protein  42.44 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0233  peptide chain release factor-like protein  42.44 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0263  peptide chain release factor-like protein  42.44 
 
 		 204 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0290  peptide chain release factor-like protein  41.26 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3597  peptide chain release factor-like protein  37.8 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4861  peptide chain release factor-like protein  40.3 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0755731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3439  peptide chain release factor-like protein  37.2 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0345  peptide chain release factor-like protein  35.82 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0354  peptide chain release factor-like protein  35.82 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0356  peptide chain release factor-like protein  35.82 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000967755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0349  peptide chain release factor-like protein  36.45 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0364  peptide chain release factor-like protein  36.45 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01750  peptide chain release factor-like protein  37.44 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  0.46874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0760  peptide chain release factor H  36.76 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3902  peptide chain release factor H  35.19 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0189567 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3371  peptide chain release factor H  43.18 
 
 		 178 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72200  peptide chain release factor-like protein  37.25 
 
 		 204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0281  peptide chain release factor-like protein  45.56 
 
 		 166 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00231  peptide chain release factor 2  42.94 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00234  hypothetical protein  42.94 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2459  peptide chain release factor H  36.63 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321859  normal  0.956081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0242  peptide chain release factor-like protein  33.85 
 
 		 219 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2039  class I peptide chain release factor  32.99 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  34.83 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1124  class I peptide chain release factor domain-containing protein  39.24 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  31.72 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  30.84 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  30.84 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  32.37 
 
 		 322 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  30.84 
 
 		 355 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  33.01 
 
 		 357 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  30.84 
 
 		 300 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  33.01 
 
 		 362 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  31.72 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  30.84 
 
 		 349 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  33.01 
 
 		 356 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  30.84 
 
 		 381 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1766  peptide chain release factor 2  30.84 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  32.16 
 
 		 367 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  30.4 
 
 		 386 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  30.84 
 
 		 347 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  31.72 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  30.77 
 
 		 343 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  29.96 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  29.96 
 
 		 357 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2027  peptide chain release factor 2  30.84 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  30.84 
 
 		 359 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  30.81 
 
 		 322 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  30.84 
 
 		 406 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  31.28 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  30.4 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  30.81 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  30.4 
 
 		 391 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  30.4 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  30.4 
 
 		 391 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  30.4 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  29.52 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  30.84 
 
 		 349 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  30.4 
 
 		 367 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  30.33 
 
 		 323 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  32.06 
 
 		 292 aa  99  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  29.52 
 
 		 417 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  31.4 
 
 		 322 aa  99  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  30.4 
 
 		 367 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  30.4 
 
 		 367 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  30.4 
 
 		 248 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  30.4 
 
 		 248 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  30.4 
 
 		 248 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  30.4 
 
 		 248 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  31.66 
 
 		 356 aa  98.6  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  31.1 
 
 		 372 aa  98.2  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  32.69 
 
 		 372 aa  98.2  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  30.65 
 
 		 372 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  30.4 
 
 		 459 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  30.66 
 
 		 330 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  31.28 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  30.47 
 
 		 369 aa  97.1  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  34.52 
 
 		 365 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  34.4 
 
 		 375 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  30.14 
 
 		 375 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  33.14 
 
 		 382 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  35.96 
 
 		 372 aa  95.9  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  29.81 
 
 		 323 aa  96.3  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  29.05 
 
 		 326 aa  95.5  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  32.54 
 
 		 357 aa  95.9  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  31.33 
 
 		 366 aa  95.9  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  31.58 
 
 		 332 aa  95.9  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 362 aa  95.5  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  32.55 
 
 		 367 aa  95.5  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  29.95 
 
 		 364 aa  95.1  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  33.53 
 
 		 332 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1500  hypothetical protein  31.73 
 
 		 293 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  31.03 
 
 		 304 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1059  peptide chain release factor 2  31.25 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304083  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  31.1 
 
 		 367 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  31.58 
 
 		 373 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  30.62 
 
 		 312 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>