More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2709 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 590 aa  1198    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  51.02 
 
 		 590 aa  601  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  41.74 
 
 		 586 aa  473  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.83 
 
 		 593 aa  353  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  34.01 
 
 		 601 aa  338  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.22 
 
 		 607 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.52 
 
 		 610 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.23 
 
 		 598 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.73 
 
 		 615 aa  296  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.72 
 
 		 624 aa  292  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  33.33 
 
 		 595 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  33.33 
 
 		 595 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.06 
 
 		 605 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  31.25 
 
 		 601 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.37 
 
 		 610 aa  277  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.42 
 
 		 626 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  31.16 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.71 
 
 		 604 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.45 
 
 		 618 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.22 
 
 		 597 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  31.83 
 
 		 597 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.63 
 
 		 597 aa  227  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.61 
 
 		 594 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  37.04 
 
 		 243 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.41 
 
 		 554 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.37 
 
 		 555 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.6 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.1 
 
 		 536 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.1 
 
 		 536 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  32.64 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  32.54 
 
 		 557 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  32.07 
 
 		 521 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.33 
 
 		 450 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  25.64 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.92 
 
 		 438 aa  101  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32 
 
 		 442 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.83 
 
 		 443 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  40.18 
 
 		 112 aa  92  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  35.47 
 
 		 910 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  35.47 
 
 		 910 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  34.01 
 
 		 887 aa  90.9  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.66 
 
 		 445 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  28.88 
 
 		 881 aa  89.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  30.73 
 
 		 848 aa  87  9e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  25.64 
 
 		 793 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  30 
 
 		 868 aa  84.3  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  32.84 
 
 		 956 aa  84.3  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  28.08 
 
 		 846 aa  83.6  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  28.74 
 
 		 917 aa  82  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  29.05 
 
 		 932 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.71 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  30.25 
 
 		 793 aa  81.3  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  26.94 
 
 		 863 aa  81.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  27.44 
 
 		 846 aa  80.9  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  31.9 
 
 		 868 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  32.54 
 
 		 900 aa  80.9  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  31.46 
 
 		 860 aa  80.5  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  28.08 
 
 		 896 aa  79.7  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  27.42 
 
 		 897 aa  79.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  31.87 
 
 		 853 aa  79  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  32.93 
 
 		 867 aa  78.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  31.14 
 
 		 855 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  32.02 
 
 		 880 aa  77.8  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2064  mismatch repair ATPase  32.56 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  30.3 
 
 		 869 aa  77  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  29.38 
 
 		 864 aa  77  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  29.78 
 
 		 869 aa  77  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  27.21 
 
 		 1205 aa  76.6  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  27 
 
 		 893 aa  76.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  31.36 
 
 		 878 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  31.55 
 
 		 918 aa  76.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 		 817 aa  76.6  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  28.14 
 
 		 854 aa  77  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  32.3 
 
 		 858 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  31.91 
 
 		 872 aa  76.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  27.88 
 
 		 828 aa  75.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  27.92 
 
 		 870 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  28.09 
 
 		 855 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  29.52 
 
 		 863 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2520  DNA mismatch repair protein MutS  30.11 
 
 		 894 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00821283  hitchhiker  0.000000391787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  28.24 
 
 		 885 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1617  DNA mismatch repair protein MutS  30.11 
 
 		 878 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  27.48 
 
 		 859 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  30.54 
 
 		 861 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  28.24 
 
 		 886 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1399  DNA mismatch repair protein MutS  29.55 
 
 		 892 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  29.94 
 
 		 856 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  28.89 
 
 		 873 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  30.28 
 
 		 804 aa  74.7  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  30.58 
 
 		 819 aa  74.7  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  30.82 
 
 		 859 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  26.62 
 
 		 898 aa  74.3  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  34.87 
 
 		 931 aa  74.3  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3589  DNA mismatch repair protein MutS  31.4 
 
 		 885 aa  74.3  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.1 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  25.95 
 
 		 851 aa  73.9  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  29.94 
 
 		 861 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  28.95 
 
 		 868 aa  73.9  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  27.4 
 
 		 750 aa  73.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  33.81 
 
 		 858 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>