More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1377 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  100 
 
 
451 aa  900    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  32.63 
 
 
421 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  34.16 
 
 
408 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  32.21 
 
 
407 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  32.28 
 
 
407 aa  203  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  35.03 
 
 
438 aa  203  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  32.16 
 
 
421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  34.59 
 
 
408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 
412 aa  195  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  35.03 
 
 
417 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  35.03 
 
 
417 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  29.8 
 
 
433 aa  193  6e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  32.08 
 
 
426 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  33.87 
 
 
419 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  31.67 
 
 
367 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  31.54 
 
 
367 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  31.54 
 
 
367 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  34.65 
 
 
390 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 
437 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  31.78 
 
 
438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  33.33 
 
 
417 aa  183  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  31.11 
 
 
372 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  31.32 
 
 
378 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  33.24 
 
 
412 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  50.93 
 
 
376 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0743  rod shape-determining protein RodA  29.41 
 
 
438 aa  172  1e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0542496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  32.41 
 
 
370 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  32.24 
 
 
382 aa  169  9e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  51.85 
 
 
381 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  49.69 
 
 
379 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  33.86 
 
 
426 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  50 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  48.09 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  42.7 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  49.07 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  49.07 
 
 
380 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  47.2 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  33.42 
 
 
370 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 
370 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  29.93 
 
 
422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  33.42 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  33.42 
 
 
370 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  34.22 
 
 
370 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  33.42 
 
 
370 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  33.42 
 
 
370 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0292  cell cycle protein  33.12 
 
 
413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  33.42 
 
 
370 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  33.42 
 
 
370 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  30.96 
 
 
366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  48.45 
 
 
383 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  33.52 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  32.98 
 
 
421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  32.89 
 
 
370 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  32.89 
 
 
370 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  32.89 
 
 
370 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  32.89 
 
 
370 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  32.89 
 
 
370 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  47.56 
 
 
373 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  49.07 
 
 
368 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  48.45 
 
 
380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  50.31 
 
 
368 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  47.83 
 
 
368 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  49.07 
 
 
368 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  47.2 
 
 
374 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  47.2 
 
 
371 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  48.45 
 
 
368 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  45.05 
 
 
368 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  45.05 
 
 
368 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  45.05 
 
 
368 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  31.44 
 
 
423 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  45.05 
 
 
368 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  47.83 
 
 
373 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  47.2 
 
 
368 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  46.55 
 
 
376 aa  160  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01655  rod shape-determining protein RodA  45.96 
 
 
253 aa  159  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  34.34 
 
 
407 aa  159  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  45.24 
 
 
384 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  45.96 
 
 
381 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  31.37 
 
 
412 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  29.93 
 
 
422 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  48.78 
 
 
378 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  30.38 
 
 
373 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  49.69 
 
 
370 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  29.91 
 
 
405 aa  158  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  49.4 
 
 
377 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  44.24 
 
 
386 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  45.96 
 
 
381 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  31.45 
 
 
429 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  50.31 
 
 
362 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  31.61 
 
 
427 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  28.74 
 
 
422 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  47.83 
 
 
366 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  29.48 
 
 
386 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  44.17 
 
 
373 aa  156  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  48.41 
 
 
407 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  49.07 
 
 
368 aa  156  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  46.95 
 
 
369 aa  156  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  50.31 
 
 
382 aa  156  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  43.96 
 
 
370 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  45.73 
 
 
371 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>