42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0356 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  293  4e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  41.61 
 
 
150 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  44.96 
 
 
146 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  45.93 
 
 
137 aa  120  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  44.12 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  41.04 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  41.61 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  37.78 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  40.88 
 
 
142 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  38.76 
 
 
154 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  40.8 
 
 
135 aa  103  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  35.07 
 
 
140 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  35.77 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  35.66 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  32.56 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  34.59 
 
 
139 aa  86.7  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  29.55 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  28.03 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  28.32 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  30.36 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  30.36 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  29.47 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  29.59 
 
 
177 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  27.41 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  25.58 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  23.28 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  28.57 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  32.37 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  29.23 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  26.61 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  26.24 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  26.13 
 
 
223 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  26.21 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  24.73 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  26.23 
 
 
158 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  25.41 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  26.5 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  26.5 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  26.5 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  26.5 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  26.5 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>