More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1347 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1347  aminotransferase class V  100 
 
 		 401 aa  795    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145912  normal  0.878821 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06940  cysteine desulfurase family protein  59.24 
 
 		 395 aa  431  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.417246  normal  0.55711 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09940  cysteine desulfurase family protein  52.86 
 
 		 392 aa  352  5e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.128931  hitchhiker  0.00000254642 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  38.68 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.09 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.51 
 
 		 394 aa  289  7e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40.51 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.15 
 
 		 414 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.99 
 
 		 384 aa  285  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.36 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.24 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  41.41 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.6 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.94 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0732  aminotransferase class V  43.73 
 
 		 382 aa  280  5e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0224667  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.45 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.78 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  40.1 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  43.33 
 
 		 1143 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  41.33 
 
 		 404 aa  272  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  41.18 
 
 		 383 aa  272  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  46.05 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  42.16 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.63 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  37.73 
 
 		 382 aa  270  4e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  38.54 
 
 		 381 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  41.33 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  40.67 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  41.33 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  41.33 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  41.33 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  41.33 
 
 		 404 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  41.33 
 
 		 404 aa  269  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.55 
 
 		 389 aa  269  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  38.54 
 
 		 381 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  42.53 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  41.07 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  41.56 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  38.79 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  39.47 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  41.42 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  38.29 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  38.29 
 
 		 381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  38.29 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  38.29 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  40.42 
 
 		 389 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  38.29 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.37 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  40.82 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  40.82 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  41.47 
 
 		 388 aa  265  8e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.42 
 
 		 388 aa  265  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40.1 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  41.19 
 
 		 404 aa  264  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  38.58 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  38.93 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  37.21 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  42.52 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  38.04 
 
 		 381 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  37.86 
 
 		 398 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  37.86 
 
 		 398 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  41.21 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  43.01 
 
 		 1139 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  37.78 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  38 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  41.51 
 
 		 388 aa  260  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  42.49 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  39.85 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  37.82 
 
 		 406 aa  260  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  40.79 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  38.64 
 
 		 402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  39.59 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.94 
 
 		 400 aa  259  8e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  39.84 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 417 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 386 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0272  cysteine desulfurase  42.53 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  41.16 
 
 		 388 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  38.02 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  38.06 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  44.59 
 
 		 422 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  38.21 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  38.42 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  43.67 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  38.58 
 
 		 407 aa  256  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  39.9 
 
 		 398 aa  256  7e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.4 
 
 		 409 aa  256  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  40.57 
 
 		 399 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  39.8 
 
 		 383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  38.64 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>