260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3222 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  96.71 
 
 		 822 aa  1647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  96.92 
 
 		 821 aa  1627    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  96.79 
 
 		 812 aa  1625    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  97.48 
 
 		 834 aa  1677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  41.02 
 
 		 829 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.47 
 
 		 832 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  41.38 
 
 		 829 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  40.85 
 
 		 816 aa  642    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  41.19 
 
 		 829 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  41.14 
 
 		 829 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  98.8 
 
 		 832 aa  1696    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4106  fimbrial usher protein  44.47 
 
 		 830 aa  749    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  41.5 
 
 		 829 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  100 
 
 		 833 aa  1718    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.88 
 
 		 819 aa  608  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  40 
 
 		 833 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.8 
 
 		 818 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  39.76 
 
 		 833 aa  607  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  39.88 
 
 		 833 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  39.63 
 
 		 816 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.57 
 
 		 835 aa  599  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  39.95 
 
 		 792 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.93 
 
 		 828 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.61 
 
 		 844 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  36.55 
 
 		 826 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.53 
 
 		 845 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.16 
 
 		 846 aa  547  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  36.31 
 
 		 826 aa  545  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.19 
 
 		 826 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  36.48 
 
 		 885 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  36.48 
 
 		 885 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  36.25 
 
 		 885 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  36.25 
 
 		 885 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3480  fimbrial usher protein  36.45 
 
 		 860 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  37.48 
 
 		 881 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  37.38 
 
 		 881 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  35.84 
 
 		 880 aa  521  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  37.14 
 
 		 881 aa  522  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  34.91 
 
 		 882 aa  521  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  35.72 
 
 		 880 aa  520  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  37.14 
 
 		 881 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2632  fimbrial usher family protein  35.68 
 
 		 881 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  35.44 
 
 		 881 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1315  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.52 
 
 		 881 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.82 
 
 		 828 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.73 
 
 		 829 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.73 
 
 		 828 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.61 
 
 		 828 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.73 
 
 		 828 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.73 
 
 		 828 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2061  MrfC  32.97 
 
 		 813 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.97 
 
 		 813 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1897  fimbrial usher protein  32.6 
 
 		 813 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1910  fimbrial usher protein  32.84 
 
 		 813 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.39 
 
 		 817 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02223  hypothetical protein  36.78 
 
 		 579 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04794  porin PapC  30.46 
 
 		 820 aa  336  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  30.15 
 
 		 878 aa  319  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  30.15 
 
 		 878 aa  319  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  29.56 
 
 		 878 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.03 
 
 		 878 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  29.43 
 
 		 863 aa  314  5.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  29.67 
 
 		 856 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.43 
 
 		 859 aa  296  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  30.74 
 
 		 848 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  30.86 
 
 		 848 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  30.74 
 
 		 848 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  30.74 
 
 		 848 aa  294  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  30.67 
 
 		 848 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.66 
 
 		 851 aa  293  7e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.12 
 
 		 861 aa  291  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  30.54 
 
 		 838 aa  290  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  30.54 
 
 		 838 aa  290  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.31 
 
 		 838 aa  289  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  30.07 
 
 		 863 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.52 
 
 		 851 aa  289  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  30.42 
 
 		 838 aa  289  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  30.07 
 
 		 838 aa  287  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.42 
 
 		 838 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  29.15 
 
 		 850 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.7 
 
 		 877 aa  286  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  29.29 
 
 		 833 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  29.08 
 
 		 833 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  28.91 
 
 		 833 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  29.02 
 
 		 839 aa  283  9e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  28.54 
 
 		 851 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  28.94 
 
 		 840 aa  281  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  28.1 
 
 		 870 aa  281  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  27.98 
 
 		 870 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  29.45 
 
 		 866 aa  280  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  27.86 
 
 		 870 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  28.57 
 
 		 866 aa  279  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.25 
 
 		 865 aa  280  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  28.25 
 
 		 861 aa  279  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  27.98 
 
 		 870 aa  280  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  28.32 
 
 		 866 aa  279  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  27.98 
 
 		 870 aa  279  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  29.14 
 
 		 809 aa  279  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  29.02 
 
 		 809 aa  278  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  29.02 
 
 		 809 aa  277  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>