83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4805 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4805  putative (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  100 
 
 
117 aa  243  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3890  putative (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  77.78 
 
 
117 aa  191  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4573  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  52.5 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0894  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  49.57 
 
 
114 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004068  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  44.14 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2099  hypothetical protein  42 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
565 aa  70.1  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
563 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0337  thioester dehydrase family protein  36.63 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0346  thioester dehydrase family protein  36.63 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4372  thioester dehydrase family protein  34.23 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0348  thioester dehydrase family protein  36.28 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3892  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  37.11 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0336  thioester dehydrase family protein  36 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3680  thioester dehydrase family protein  35.64 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 
557 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0343  thioester dehydrase family protein  35 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0442  thioester dehydrase family protein  35 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4600  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  35.4 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0346  thioester dehydrase family protein  35 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0338  thioester dehydrase family protein  35 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 
559 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 
551 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3383  thioester dehydrase family protein  32.46 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3515  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  33.01 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
561 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0321  thioester dehydrase family protein  33.33 
 
 
125 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 
562 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 
615 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  30.7 
 
 
524 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0113  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-[acyl- carrier-protein] dehydratase  35.21 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 
568 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 
557 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 
557 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  33.72 
 
 
563 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 
593 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
563 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  37.84 
 
 
563 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0436  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  23.68 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.28393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1359  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.77 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691749  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1024  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.72 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.859124  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1077  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.72 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000662978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3424  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.72 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010114  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2804  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.47 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0249  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.87 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0268  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.87 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000119785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2969  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  32.43 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000324792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0253  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.87 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.68126  normal  0.786881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0265  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.87 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0249  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.87 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.372567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2630  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.47 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000191637  normal  0.0828636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2697  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.47 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000017276  hitchhiker  0.00306361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  33.33 
 
 
591 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2891  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.42 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000212141  normal  0.60734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1640  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.42 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1456  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.42 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126411  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1461  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.42 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1492  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.42 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000642129  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0718  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.57 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000876303  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0173  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00177  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000343822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0184  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000138617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0182  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000474008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0190  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000195113  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00178  (3R)-hydroxymyristoyl ACP dehydratase  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000281915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3779  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  27 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301111  hitchhiker  0.00154059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3480  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000099524  normal  0.030316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0191  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000184582  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2798  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  35.9 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673161  normal  0.655992 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002758  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  31.52 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.941344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0952  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.72 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3349  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.72 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000202001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4174  hypothetical protein  31.4 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1840  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.43 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0477677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2514  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  31.88 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0181011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1379  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  30.23 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413196  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14971  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.35 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3154  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.57 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0026006  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15361  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.26 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1434  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  32.05 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3042  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.72 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462423  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2416  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  32.88 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0537  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  29.73 
 
 
149 aa  40  0.01  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.514028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>