More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2090 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  100 
 
 		 354 aa  704    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  78.98 
 
 		 353 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2726  chorismate synthase  76.57 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  66.86 
 
 		 354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  63.69 
 
 		 359 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  62.68 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2288  chorismate synthase  63.33 
 
 		 364 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000146456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  59.59 
 
 		 351 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  54.6 
 
 		 369 aa  381  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  53.45 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1345  chorismate synthase  55.75 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  55.68 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  52.87 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2593  chorismate synthase  56.32 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  52.81 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  54.6 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  54.6 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  53.68 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  54.26 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  51.3 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  54.31 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  54.31 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  51.15 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  54.31 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  52.3 
 
 		 364 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  54.31 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  54.31 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  54.31 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  51.15 
 
 		 361 aa  362  4e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  54.31 
 
 		 361 aa  362  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  54.6 
 
 		 361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  52.87 
 
 		 368 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  54.6 
 
 		 361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  53.98 
 
 		 364 aa  361  9e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  54.02 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  52.84 
 
 		 358 aa  358  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  54.02 
 
 		 361 aa  358  8e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  54.31 
 
 		 361 aa  358  9e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  54.02 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  54.02 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  54.02 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  54.02 
 
 		 361 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  54.02 
 
 		 361 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  50.57 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  52.01 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  51.15 
 
 		 364 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  51.72 
 
 		 365 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  52.01 
 
 		 369 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  52.01 
 
 		 369 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  51.15 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  51.15 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  51.15 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  52.01 
 
 		 430 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  50.57 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  50.56 
 
 		 373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  50.86 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  49.71 
 
 		 362 aa  352  4e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0009  chorismate synthase  53.54 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  51.72 
 
 		 369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  51.72 
 
 		 369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  51.72 
 
 		 366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  51.72 
 
 		 369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  51.44 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  51.15 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  50 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  50.99 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  51.15 
 
 		 369 aa  349  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  51.15 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  50.86 
 
 		 376 aa  349  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  53.45 
 
 		 361 aa  348  8e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  53.26 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  49.58 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  53.74 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  53.74 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  53.74 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  49.71 
 
 		 364 aa  345  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  53.06 
 
 		 334 aa  345  6e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  49.14 
 
 		 371 aa  345  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  50.7 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  50 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  50.54 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  51.15 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  51.15 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  52.01 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  50.86 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  50.7 
 
 		 358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  51.15 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  51.15 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  51.25 
 
 		 361 aa  342  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  52.01 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  50 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  48.86 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  53.33 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4332  chorismate synthase  52.39 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  49.14 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4770  chorismate synthase  52.82 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00112305  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  51.11 
 
 		 373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  50.57 
 
 		 393 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  50.84 
 
 		 357 aa  338  5.9999999999999996e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>