More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0263 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  72.16 
 
 		 564 aa  856    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  79.18 
 
 		 562 aa  917    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 564 aa  1154    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  41.9 
 
 		 551 aa  440  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1829  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  36.7 
 
 		 557 aa  332  1e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 553 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 610 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 620 aa  260  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 609 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.1 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 570 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.71 
 
 		 610 aa  256  9e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 607 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  30.51 
 
 		 624 aa  250  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 576 aa  247  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 605 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 592 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 		 1542 aa  244  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 610 aa  242  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 610 aa  242  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 633 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 572 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  34.79 
 
 		 811 aa  237  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.81 
 
 		 575 aa  236  6e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 633 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  31.65 
 
 		 1537 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  32.09 
 
 		 824 aa  230  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  33.4 
 
 		 824 aa  230  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 825 aa  230  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 		 603 aa  229  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 612 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 1538 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 1538 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 603 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 887 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 605 aa  220  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 825 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 903 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 824 aa  218  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 606 aa  217  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 608 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 603 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.09 
 
 		 603 aa  212  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 604 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  31.72 
 
 		 580 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 604 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 604 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 580 aa  207  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.4 
 
 		 587 aa  207  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 812 aa  206  6e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 1557 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 592 aa  206  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 605 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 630 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 599 aa  203  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 601 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 		 607 aa  200  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 652 aa  200  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 525 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 669 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 		 601 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 918 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.43 
 
 		 601 aa  198  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 		 567 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 601 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  28.01 
 
 		 602 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 		 601 aa  195  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 		 660 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 509 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 599 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 		 601 aa  193  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 591 aa  193  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 632 aa  193  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 547 aa  193  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 630 aa  192  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  26.35 
 
 		 601 aa  193  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 		 601 aa  193  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.36 
 
 		 598 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 511 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  26.83 
 
 		 663 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.2 
 
 		 514 aa  192  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.04 
 
 		 602 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 599 aa  191  4e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.56 
 
 		 614 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  26.18 
 
 		 588 aa  190  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 595 aa  190  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0054  AMP-dependent synthetase and ligase  26.95 
 
 		 625 aa  189  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.412311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 607 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 616 aa  189  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 638 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  32.57 
 
 		 597 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  30.21 
 
 		 630 aa  188  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 594 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  28.36 
 
 		 592 aa  188  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 		 660 aa  187  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.39 
 
 		 599 aa  187  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 603 aa  187  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>