More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1366 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 424 aa  844    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  45.65 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  48 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  47.42 
 
 		 432 aa  378  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  45.02 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  48.06 
 
 		 428 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  44.81 
 
 		 432 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  42.79 
 
 		 440 aa  361  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  43.06 
 
 		 439 aa  359  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 		 431 aa  358  9e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 		 431 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  46.91 
 
 		 431 aa  355  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  41.76 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 436 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  46.35 
 
 		 418 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  41.86 
 
 		 436 aa  345  7e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  42.09 
 
 		 436 aa  345  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  41.28 
 
 		 441 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 435 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_002936  DET1206  homoserine dehydrogenase  44.76 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  42.56 
 
 		 436 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_989  homoserine dehydrogenase  44.89 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1016  homoserine dehydrogenase  45.13 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00327317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  40.9 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  40.7 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  40.7 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 439 aa  336  5e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  41.87 
 
 		 436 aa  333  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  40.04 
 
 		 469 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  41.3 
 
 		 438 aa  330  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  43.02 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  39.53 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  42.3 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  40.46 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 		 432 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  44.65 
 
 		 427 aa  322  9.999999999999999e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  40.27 
 
 		 445 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  39.22 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  39.45 
 
 		 442 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  39.3 
 
 		 463 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  39.3 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  38.99 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  38.99 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  41.1 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  39.06 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 		 434 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  40.4 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  39.07 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  39.22 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  39.07 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  40.24 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  42.76 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  41.18 
 
 		 449 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  39.52 
 
 		 438 aa  316  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  40.4 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  40.4 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  40.4 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  38.6 
 
 		 434 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  40.4 
 
 		 431 aa  315  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  38.6 
 
 		 434 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  40.4 
 
 		 431 aa  315  7e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  40.54 
 
 		 437 aa  315  9e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  40.4 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  43.53 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  41.82 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  39.47 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  39.44 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  40.85 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  38.67 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  39.49 
 
 		 438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  39.07 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  37.07 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  42.35 
 
 		 440 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  41.91 
 
 		 438 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  41.63 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  36.74 
 
 		 448 aa  312  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  38.22 
 
 		 443 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  38.76 
 
 		 442 aa  312  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  38.22 
 
 		 443 aa  312  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  39.3 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  43.74 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  38.3 
 
 		 442 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  38.19 
 
 		 436 aa  309  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  38.63 
 
 		 448 aa  309  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>