More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1046 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  66.6 
 
 
480 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  70.59 
 
 
479 aa  648    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  984    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  68.41 
 
 
481 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  75.21 
 
 
479 aa  732    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  81.3 
 
 
478 aa  765    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  99.59 
 
 
485 aa  980    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  66.67 
 
 
498 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  77.73 
 
 
480 aa  740    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  77.52 
 
 
480 aa  738    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  83.61 
 
 
482 aa  816    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  69.12 
 
 
479 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.86 
 
 
480 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  86.97 
 
 
482 aa  806    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  67.63 
 
 
479 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  81.26 
 
 
480 aa  782    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  78.87 
 
 
479 aa  761    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  68.29 
 
 
480 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  65.34 
 
 
477 aa  628  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  67.92 
 
 
482 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  65.14 
 
 
477 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  65.34 
 
 
477 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  65.34 
 
 
477 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  64.93 
 
 
477 aa  623  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  63.16 
 
 
475 aa  615  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  63.67 
 
 
482 aa  598  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  64.03 
 
 
477 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  67.52 
 
 
446 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  60.5 
 
 
478 aa  583  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  59.07 
 
 
476 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  58.86 
 
 
480 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  58.69 
 
 
480 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  56.99 
 
 
480 aa  558  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  59.54 
 
 
483 aa  561  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  58.32 
 
 
483 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  56.45 
 
 
482 aa  538  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  54.22 
 
 
486 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  54.64 
 
 
486 aa  521  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  52.95 
 
 
486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  52.82 
 
 
491 aa  513  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  52.4 
 
 
487 aa  510  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
478 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  52.92 
 
 
484 aa  503  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  51.04 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  54.2 
 
 
478 aa  480  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  65.92 
 
 
441 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  51.98 
 
 
482 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  46.96 
 
 
482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  44 
 
 
479 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  44.05 
 
 
493 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  44.83 
 
 
483 aa  378  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  49.28 
 
 
474 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  41.89 
 
 
505 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
488 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
498 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  41.74 
 
 
497 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  42.53 
 
 
503 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  40.72 
 
 
499 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  43.63 
 
 
483 aa  365  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  43.16 
 
 
500 aa  364  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  41.3 
 
 
496 aa  363  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  44.12 
 
 
482 aa  358  8e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  44.84 
 
 
516 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  43.67 
 
 
493 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  47.17 
 
 
497 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  41.74 
 
 
498 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  47.69 
 
 
505 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  44.21 
 
 
493 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  42.11 
 
 
481 aa  352  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  41.47 
 
 
482 aa  347  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
485 aa  346  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  42.15 
 
 
498 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.53 
 
 
496 aa  343  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  40.47 
 
 
484 aa  342  9e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
491 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  40.67 
 
 
496 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  41.04 
 
 
483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
485 aa  334  2e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  37.63 
 
 
478 aa  332  7.000000000000001e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  39.55 
 
 
483 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.27 
 
 
496 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  43.57 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.59 
 
 
498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.25 
 
 
484 aa  319  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  39.34 
 
 
501 aa  317  4e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
497 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 
501 aa  312  7.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5826  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
485 aa  312  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26319  normal  0.439131 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  38.1 
 
 
506 aa  312  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.46 
 
 
508 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
483 aa  310  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  40.32 
 
 
494 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2030  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase (HpaE)  39.96 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0934174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 
493 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
491 aa  307  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2311  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
506 aa  307  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  39.53 
 
 
480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.67 
 
 
496 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>