More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0846 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0846  Resolvase domain protein  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3594  resolvase domain-containing protein  72.28 
 
 		 197 aa  238  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.00636554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2399  resolvase domain-containing protein  71.2 
 
 		 197 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  50.28 
 
 		 203 aa  177  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  47.28 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  52.98 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  45.86 
 
 		 186 aa  157  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  45.86 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  48.37 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  46.63 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 187 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  54.42 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  54.42 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  52.17 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  50.94 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  50.93 
 
 		 188 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  51.55 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  50.31 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  44.51 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  45.66 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  47.98 
 
 		 188 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  49.07 
 
 		 189 aa  141  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  47.4 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  44.75 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  44.51 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40.33 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  45.4 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  43.78 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  44.51 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 		 196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0718  resolvase domain-containing protein  47.75 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.784479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  46.24 
 
 		 185 aa  138  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  46.24 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  45.09 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  45.09 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  41.81 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  38.12 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  41.81 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  39.43 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  41.81 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  39.43 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  41.24 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  51.77 
 
 		 307 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  51.77 
 
 		 307 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  43.93 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  43.93 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  45.39 
 
 		 176 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  46.37 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  42.22 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  43.93 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  42.16 
 
 		 190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  45.09 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  47.33 
 
 		 293 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  45.09 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  42.78 
 
 		 184 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  47.33 
 
 		 298 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  44.16 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  47.33 
 
 		 326 aa  127  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  46.62 
 
 		 305 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  52.59 
 
 		 313 aa  127  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  42.05 
 
 		 309 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  53.33 
 
 		 309 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  40.91 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  48 
 
 		 293 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  42.46 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  46.67 
 
 		 294 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  53.6 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  40.37 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  46 
 
 		 294 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  46.78 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  49.59 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  46 
 
 		 293 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  47.52 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  47.26 
 
 		 293 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  49.26 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  46.26 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  43.53 
 
 		 193 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  48.59 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  45.22 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  49.29 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  44.58 
 
 		 324 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  38.54 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  48 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  46.75 
 
 		 184 aa  118  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  40.68 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  49.63 
 
 		 310 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  38.54 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  45.09 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  40.22 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  41.3 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  37.22 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  40.86 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>