51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0650 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  100 
 
 
315 aa  624  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  98.73 
 
 
381 aa  614  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  60.3 
 
 
357 aa  348  8e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  60.25 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  57.14 
 
 
314 aa  310  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  55.23 
 
 
343 aa  308  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  53.4 
 
 
325 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  50.32 
 
 
325 aa  279  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  48.88 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  50.33 
 
 
332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  44.84 
 
 
327 aa  235  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  36.79 
 
 
336 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  36.16 
 
 
337 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  32.25 
 
 
416 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  32.25 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  32.25 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  32.25 
 
 
416 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  32.25 
 
 
416 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  32.25 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  32.25 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  32.63 
 
 
373 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  31.53 
 
 
373 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  32.34 
 
 
417 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  31.34 
 
 
375 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  30.84 
 
 
374 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  31.36 
 
 
369 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  31.36 
 
 
369 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  30.77 
 
 
369 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  31.69 
 
 
362 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  31.45 
 
 
577 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  30.45 
 
 
431 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  31.1 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  30.22 
 
 
352 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  28.96 
 
 
367 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  31.99 
 
 
331 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  26.71 
 
 
321 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  26.69 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  28.2 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  27.92 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  26.6 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  27.46 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  25.72 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  28.46 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  26.03 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  25.72 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  26.05 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  30.26 
 
 
357 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  28.49 
 
 
322 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  28.79 
 
 
322 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  29.17 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  25.26 
 
 
336 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>