More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0928 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
537 aa  1107    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  40.75 
 
 
544 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  39.63 
 
 
560 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  38.06 
 
 
552 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  38.25 
 
 
549 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  37.87 
 
 
549 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  37.31 
 
 
552 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  37.71 
 
 
553 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  37.15 
 
 
549 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  38.78 
 
 
552 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 
554 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  40.12 
 
 
576 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  37.94 
 
 
562 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  39.85 
 
 
560 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  39.81 
 
 
560 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  37.52 
 
 
576 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  39.24 
 
 
560 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 
562 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  38.74 
 
 
557 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 
566 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  39.81 
 
 
561 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  38.2 
 
 
557 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  37.38 
 
 
550 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 
566 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  37.41 
 
 
547 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  38.55 
 
 
550 aa  373  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  37.84 
 
 
562 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  39.05 
 
 
560 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  37.21 
 
 
571 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 
566 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  36.38 
 
 
576 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
571 aa  371  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  36.93 
 
 
576 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  36.33 
 
 
570 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  38.5 
 
 
564 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  37.34 
 
 
557 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 
564 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  36.62 
 
 
576 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  36.59 
 
 
575 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  37.26 
 
 
565 aa  369  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  35.88 
 
 
571 aa  369  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  35.69 
 
 
571 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  35.89 
 
 
564 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  37.05 
 
 
576 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  37.81 
 
 
549 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  36.57 
 
 
548 aa  363  4e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  36.1 
 
 
605 aa  362  1e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  34.83 
 
 
552 aa  361  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  37.03 
 
 
576 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  37.02 
 
 
565 aa  359  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  37.03 
 
 
576 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  37.45 
 
 
576 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  35.93 
 
 
564 aa  359  7e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  36.23 
 
 
548 aa  359  7e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  36.84 
 
 
549 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  37.03 
 
 
576 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  37.81 
 
 
550 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  37.33 
 
 
549 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  37.03 
 
 
576 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  37.03 
 
 
576 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  37.03 
 
 
570 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  35.43 
 
 
575 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  36.05 
 
 
578 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  35.24 
 
 
575 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  35.85 
 
 
561 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  35.24 
 
 
575 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  35.05 
 
 
575 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  35.24 
 
 
575 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  37.4 
 
 
578 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  35.24 
 
 
575 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  36.14 
 
 
549 aa  353  4e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  36.93 
 
 
570 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  36.93 
 
 
570 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  36.93 
 
 
570 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  35.92 
 
 
574 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  36.48 
 
 
550 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  36.74 
 
 
542 aa  351  2e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  35.85 
 
 
549 aa  351  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  36.93 
 
 
573 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  37.27 
 
 
546 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  37.57 
 
 
546 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 
843 aa  349  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  37.82 
 
 
546 aa  349  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 
566 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  36.83 
 
 
574 aa  348  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  37.43 
 
 
570 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  36.31 
 
 
570 aa  345  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  35.27 
 
 
584 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 
563 aa  345  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  34.86 
 
 
568 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  34.8 
 
 
572 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  35.08 
 
 
602 aa  343  4e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
544 aa  343  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  37.02 
 
 
570 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0354  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 
576 aa  342  9e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  35.1 
 
 
568 aa  341  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  34.91 
 
 
596 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 
558 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.37 
 
 
579 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  35.88 
 
 
579 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>