260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0550 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0550  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  30.1 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  35.96 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1556  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  29.91 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  29.13 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  28.74 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  30.36 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  29.29 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2515  putative transcriptional regulator, ArsR family protein  29.13 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0062  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  34.95 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4432  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3598  ArsR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  38.64 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  27 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5579  ArsR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  32.35 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  30.11 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05266  hypothetical protein  29.52 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0027  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.669383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  26.09 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  29.41 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  30 
 
 		 358 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  32.35 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  31.33 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02582  hypothetical protein  27.78 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01497  hypothetical protein  27.78 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0201  hypothetical protein  28.16 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  29.21 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  29.29 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  25.44 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001377  transcriptional regulator ArsR family  25.71 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000883282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  26.42 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  26.42 
 
 		 244 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3796  ArsR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315297 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08198  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862808  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  22.02 
 
 		 349 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  29.46 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  35.56 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1499  ArsR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  26.42 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  28.32 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 227 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  28.57 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  26.88 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3987  ArsR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  27.66 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  28.57 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0587  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  25 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  31.18 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  37.88 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>