More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0403 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  100 
 
 
430 aa  880    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  40.05 
 
 
431 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0281  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  31.98 
 
 
423 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0757727  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  25.33 
 
 
444 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  31.87 
 
 
459 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2003  nitrogenase  27.17 
 
 
450 aa  99.8  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.577427  normal  0.745673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  27.53 
 
 
463 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  26.8 
 
 
460 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  24.92 
 
 
448 aa  93.6  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  27.46 
 
 
466 aa  93.2  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  26.91 
 
 
452 aa  90.5  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.67 
 
 
517 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1566  nitrogenase  22.96 
 
 
447 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.77 
 
 
532 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.64 
 
 
509 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  25.32 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.65 
 
 
540 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  23.81 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  28.77 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  23.81 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.53 
 
 
508 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2888  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.24 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.16 
 
 
508 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.34 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.86 
 
 
531 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.1 
 
 
535 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0772  nitrogenase  29.27 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  22.44 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.94 
 
 
544 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.34 
 
 
530 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.82 
 
 
531 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.05 
 
 
524 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  20.62 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  27.2 
 
 
476 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02610  vanadium nitrogenase, alpha subunit, vnfD  24.14 
 
 
474 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.65 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.12 
 
 
526 aa  71.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.77 
 
 
530 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.94 
 
 
508 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.82 
 
 
534 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.82 
 
 
534 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1756  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25 
 
 
453 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00502819  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.29 
 
 
525 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  27.31 
 
 
501 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  21.83 
 
 
462 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.65 
 
 
506 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.22 
 
 
541 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.29 
 
 
525 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.42 
 
 
546 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  29.12 
 
 
508 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1517  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  22.87 
 
 
463 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.302679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1345  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.68 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.830922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1235  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  22.87 
 
 
463 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01450  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.32 
 
 
475 aa  67  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  24.07 
 
 
511 aa  67  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2325  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  23.13 
 
 
502 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.54 
 
 
551 aa  66.6  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  24.36 
 
 
516 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.5 
 
 
536 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.41 
 
 
542 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4251  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.32 
 
 
905 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02770  nitrogenase vanadium iron cofactor biosynthesis protein vnfE  25.34 
 
 
469 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687288  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0772  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  28.36 
 
 
441 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7729  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.51 
 
 
497 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.66 
 
 
519 aa  65.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.53 
 
 
546 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1632  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.65 
 
 
453 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00463409  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1013  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.21 
 
 
456 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153138  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0551  nitrogenase component I, alpha chain  25.76 
 
 
486 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.39708  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.02 
 
 
508 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.95 
 
 
348 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.05 
 
 
541 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.05 
 
 
544 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1954  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.31 
 
 
453 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.396368  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.32 
 
 
539 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1531  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.73 
 
 
546 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  24.35 
 
 
482 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25 
 
 
489 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.21 
 
 
467 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  22.13 
 
 
462 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.96 
 
 
512 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.22 
 
 
528 aa  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.57 
 
 
508 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.38 
 
 
507 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.27 
 
 
545 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  23.75 
 
 
518 aa  63.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.66 
 
 
540 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  22.41 
 
 
462 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.41 
 
 
541 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.32 
 
 
519 aa  63.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.37 
 
 
462 aa  63.2  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.74 
 
 
539 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2620  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  25.42 
 
 
474 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  22.13 
 
 
462 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2611  nitrogenase alpha chain  24.83 
 
 
523 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.718725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.41 
 
 
489 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2286  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  26.48 
 
 
482 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2908  Nitrogenase  28.07 
 
 
502 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0168  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.17 
 
 
533 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488812  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.6 
 
 
533 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>