More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4162 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 347 aa  665    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  55.07 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4362  glycosyl transferase, group 1  60.82 
 
 		 349 aa  338  8e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  54.52 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  44.08 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  43.02 
 
 		 356 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  44.58 
 
 		 350 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4785  glycosyl transferase group 1  44.31 
 
 		 350 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195851  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  38.62 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  37.87 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 		 349 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2455  glycosyl transferase group 1  41.34 
 
 		 357 aa  162  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 		 639 aa  159  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  38.85 
 
 		 344 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  37.27 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  35.76 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 		 400 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0391  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 457 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 		 408 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0797  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 360 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  37.28 
 
 		 398 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 		 408 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 		 408 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 		 408 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  36.15 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  35.91 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0542  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 		 351 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 452 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  31.98 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 458 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.05 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0644  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 420 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 		 386 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0573  putative glycosyl transferase  32.95 
 
 		 425 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.478763  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 		 377 aa  86.3  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 385 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  38.92 
 
 		 374 aa  85.9  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.76 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 1261 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  37.23 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  36.06 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  36.87 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  35.78 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  42.96 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  38.25 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  29.32 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  26.64 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  38.97 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  26.2 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  37.89 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3893  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 414 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  39.25 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  40.94 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>