75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3207 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3207  protein of unknown function DUF989  100 
 
 		 410 aa  842    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.175006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  79.61 
 
 		 413 aa  667    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  66.18 
 
 		 415 aa  552  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  66.09 
 
 		 419 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3889  hypothetical protein  61.67 
 
 		 408 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  61.08 
 
 		 411 aa  511  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3268  hypothetical protein  61.18 
 
 		 406 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152004 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3583  class I monoheme cytochrome c  61.43 
 
 		 406 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  60.88 
 
 		 414 aa  504  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3325  hypothetical protein  60.3 
 
 		 410 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  58.45 
 
 		 412 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2837  hypothetical protein  58.09 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4495  hypothetical protein  59.31 
 
 		 410 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122524  normal  0.0576102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2869  protein of unknown function DUF989  57.88 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3141  protein of unknown function DUF989  58.31 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2045  hypothetical protein  47.12 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6197  hypothetical protein  48.91 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  46.25 
 
 		 407 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2061  protein of unknown function DUF989  43.8 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.076874  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1742  hypothetical protein  43.8 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1071  protein of unknown function DUF989  43.8 
 
 		 416 aa  325  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  decreased coverage  0.0064959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2761  hypothetical protein  38.92 
 
 		 430 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3709  hypothetical protein  39.9 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1702  hypothetical protein  37.79 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3670  hypothetical protein  39.76 
 
 		 421 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.753123  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  37.5 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2426  hypothetical protein  41.35 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2384  hypothetical protein  41.35 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.739988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2529  hypothetical protein  41.35 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0707182  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  37.78 
 
 		 442 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  37.78 
 
 		 442 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3615  hypothetical protein  37.56 
 
 		 442 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  37.44 
 
 		 446 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1982  hypothetical protein  40.4 
 
 		 397 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964885 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1958  hypothetical protein  40.4 
 
 		 397 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1946  hypothetical protein  40.4 
 
 		 397 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6120  hypothetical protein  40.4 
 
 		 397 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1311  hypothetical protein  39.36 
 
 		 397 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2071  hypothetical protein  41.1 
 
 		 400 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5269  hypothetical protein  39.85 
 
 		 397 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2115  hypothetical protein  42.51 
 
 		 414 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.766532 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1873  hypothetical protein  40.4 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  0.121684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1932  hypothetical protein  41 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.781025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1345  protein of unknown function DUF989  37.25 
 
 		 397 aa  279  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1805  hypothetical protein  37.16 
 
 		 430 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.916296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1932  protein of unknown function DUF989  39.14 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0776481 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4873  hypothetical protein  36.88 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2325  protein of unknown function DUF989  40.55 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.547716  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2430  hypothetical protein  37.28 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2255  protein of unknown function DUF989  38.83 
 
 		 418 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2433  hypothetical protein  40.75 
 
 		 401 aa  276  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44880  hypothetical protein  39.29 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.798821  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3822  hypothetical protein  39.05 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21090  hypothetical protein  39.75 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0855882  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1142  hypothetical protein  40.19 
 
 		 406 aa  268  8.999999999999999e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1295  hypothetical protein  39.5 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1917  hypothetical protein  34.23 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.159844  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3922  protein of unknown function DUF989  38.73 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1430  putative transmembrane protein  38.88 
 
 		 405 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1151  hypothetical protein  39.75 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0886  hypothetical protein  40.2 
 
 		 402 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0272876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02521  predicted membrane protein  37.08 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1119  hypothetical protein  38.12 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0780  putative transmembrane protein  39.51 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1048  protein of unknown function DUF989  38.52 
 
 		 401 aa  250  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1128  hypothetical protein  38.27 
 
 		 401 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143546  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0357  hypothetical protein  38.97 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  34.81 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1103  hypothetical protein  37.62 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0780  hypothetical protein  37.23 
 
 		 408 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  35.25 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2128  hypothetical protein  43.93 
 
 		 443 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  30.99 
 
 		 202 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  24.03 
 
 		 174 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  34.38 
 
 		 204 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>