241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2858 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2858  purine nucleoside phosphorylase  100 
 
 
234 aa  480  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0799  purine nucleoside phosphorylase  83.33 
 
 
234 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.467388  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3108  purine nucleoside phosphorylase  74.79 
 
 
234 aa  362  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1513  purine-nucleoside phosphorylase  56.78 
 
 
243 aa  271  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0821603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1391  purine nucleoside phosphorylase  53.45 
 
 
235 aa  268  5e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000867516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  53.88 
 
 
235 aa  266  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  53.02 
 
 
235 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1863  purine nucleoside phosphorylase  54.31 
 
 
235 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  53.88 
 
 
235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  53.88 
 
 
235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  53.88 
 
 
235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  53.88 
 
 
235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  53.88 
 
 
235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  53.88 
 
 
235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  53.88 
 
 
235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  53.88 
 
 
235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  53.88 
 
 
235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2420  purine nucleoside phosphorylase  55.36 
 
 
236 aa  265  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  53.88 
 
 
235 aa  265  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  54.11 
 
 
235 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0463  purine nucleoside phosphorylase  54.7 
 
 
233 aa  256  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0259121  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0203  purine nucleoside phosphorylase  54.04 
 
 
235 aa  254  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2832  purine nucleoside phosphorylase  53.65 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1978  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
234 aa  248  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  51.72 
 
 
233 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3330  purine nucleoside phosphorylase  51.74 
 
 
241 aa  244  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3449  purine nucleoside phosphorylase  51.29 
 
 
241 aa  244  9e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1497  purine nucleoside phosphorylase  52.36 
 
 
261 aa  243  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0231  purine nucleoside phosphorylase  53.25 
 
 
235 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691256  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0083  purine nucleoside phosphorylase  51.72 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0506882  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2864  purine nucleoside phosphorylase  52.79 
 
 
236 aa  238  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.304471  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  48.7 
 
 
232 aa  238  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3495  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  238  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3624  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
239 aa  238  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001249  purine nucleoside phosphorylase  51.08 
 
 
236 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328135  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05118  purine nucleoside phosphorylase  51.08 
 
 
236 aa  237  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04260  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0828  purine-nucleoside phosphorylase  52.84 
 
 
243 aa  236  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3672  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.398843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3381  purine nucleoside phosphorylase  50.43 
 
 
235 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04226  hypothetical protein  49.57 
 
 
239 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3614  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4619  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4933  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857632  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4931  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5899  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4983  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1793  purine nucleoside phosphorylase  51.53 
 
 
232 aa  235  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000806796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0663  purine nucleoside phosphorylase  49.58 
 
 
243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0602  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  235  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0824  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  234  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.02467  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3546  purine nucleoside phosphorylase  50.65 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.799796  hitchhiker  0.000820133 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0828  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0544  purine nucleoside phosphorylase  50.21 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.353867  normal  0.0917006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4892  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4985  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4926  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416667  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4824  purine nucleoside phosphorylase  49.57 
 
 
239 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1028  purine nucleoside phosphorylase  51.08 
 
 
236 aa  231  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.263223  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4978  purine nucleoside phosphorylase  49.14 
 
 
239 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1221  purine nucleoside phosphorylase  50.65 
 
 
236 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0288  purine nucleoside phosphorylase  48.07 
 
 
238 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.324122  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1040  purine nucleoside phosphorylase  50.65 
 
 
236 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.540297  hitchhiker  0.00000698922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1105  purine nucleoside phosphorylase  50.65 
 
 
236 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1044  purine nucleoside phosphorylase  50.65 
 
 
236 aa  230  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0635  purine nucleoside phosphorylase  50 
 
 
236 aa  230  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2819  purine nucleoside phosphorylase  51.08 
 
 
236 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1005  purine nucleoside phosphorylase  50.43 
 
 
236 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3884  purine nucleoside phosphorylase  50.85 
 
 
236 aa  229  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000380041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0976  purine nucleoside phosphorylase  50.65 
 
 
236 aa  229  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2812  purine nucleoside phosphorylase  50.65 
 
 
236 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0651432  unclonable  0.00000308017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3375  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 
236 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.284651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3045  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 
236 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0752  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 
238 aa  228  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3224  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 
236 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3363  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 
236 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3227  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 
236 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1143  purine nucleoside phosphorylase  50.22 
 
 
236 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000418679 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1003  purine nucleoside phosphorylase  48.93 
 
 
234 aa  225  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00510571  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0457  purine nucleoside phosphorylase  48.92 
 
 
236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0510  purine nucleoside phosphorylase  47.19 
 
 
236 aa  225  6e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002632  purine nucleoside phosphorylase  46.12 
 
 
239 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2719  purine nucleoside phosphorylase  48.07 
 
 
234 aa  222  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0114  purine nucleoside phosphorylase  47.66 
 
 
236 aa  222  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000527057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1838  purine nucleoside phosphorylase  48.07 
 
 
234 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.336588  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1657  purine nucleoside phosphorylase  47.64 
 
 
234 aa  221  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0417756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2503  purine nucleoside phosphorylase  47.64 
 
 
234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.263795  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3271  purine nucleoside phosphorylase  47.41 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1926  purine nucleoside phosphorylase  46.98 
 
 
241 aa  218  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3612  purine nucleoside phosphorylase  45.92 
 
 
236 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1178  purine nucleoside phosphorylase  48.92 
 
 
236 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0122  purine nucleoside phosphorylase  50.68 
 
 
235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000853984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0127  purine nucleoside phosphorylase  50.68 
 
 
235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3422  purine nucleoside phosphorylase  47.84 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1072  purine nucleoside phosphorylase  47.66 
 
 
236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.79397  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2174  purine nucleoside phosphorylase  47.19 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2212  purine nucleoside phosphorylase  47.19 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3784  purine nucleoside phosphorylase  45.26 
 
 
234 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0971  purine nucleoside phosphorylase  44.64 
 
 
239 aa  209  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03374  purine nucleoside phosphorylase  45.69 
 
 
269 aa  208  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>