More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1293 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0008  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.77 
 
 
607 aa  643    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.382171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4418  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.66 
 
 
607 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0582  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.14 
 
 
607 aa  713    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0623132  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5030  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.61 
 
 
608 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.65 
 
 
608 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487309  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4526  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.69 
 
 
608 aa  712    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697657  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.39 
 
 
608 aa  691    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0607297 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4910  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.2 
 
 
608 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.45 
 
 
603 aa  851    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0810967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1910  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.65 
 
 
608 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701162  normal  0.896342 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.03 
 
 
607 aa  683    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0755  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.28 
 
 
607 aa  661    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.255039  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6177  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.41 
 
 
608 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3375  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.2 
 
 
608 aa  727    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2854  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.03 
 
 
608 aa  697    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1202  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.33 
 
 
607 aa  714    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10337  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3186  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  68.81 
 
 
602 aa  827    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1404  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.58 
 
 
608 aa  663    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247017  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2606  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.05 
 
 
608 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659057  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5508  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.69 
 
 
608 aa  741    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4068  hypothetical protein  57.33 
 
 
603 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.035977  normal  0.145106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2618  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.53 
 
 
608 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2057  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.39 
 
 
608 aa  688    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776595  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2017  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.28 
 
 
603 aa  848    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.851837  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  67.49 
 
 
602 aa  820    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1366  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.8 
 
 
607 aa  698    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2418  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.87 
 
 
608 aa  722    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316108  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0708  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.61 
 
 
612 aa  652    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2276  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.84 
 
 
607 aa  660    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1706  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.97 
 
 
607 aa  709    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80157  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1164  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.29 
 
 
603 aa  850    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402042  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1293  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  100 
 
 
606 aa  1232    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921081  normal  0.297971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4640  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.69 
 
 
608 aa  711    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.972061  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4157  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.69 
 
 
608 aa  712    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.717296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1801  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  55.63 
 
 
611 aa  646    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2934  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.2 
 
 
608 aa  704    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.729718  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1826  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.35 
 
 
608 aa  733    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2171  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.11 
 
 
608 aa  648    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3067  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.81 
 
 
607 aa  703    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.82118  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.39 
 
 
608 aa  702    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0547  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.14 
 
 
607 aa  713    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4553  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.25 
 
 
608 aa  695    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0619  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  66.72 
 
 
605 aa  798    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247891  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.64 
 
 
607 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3455  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  53.51 
 
 
610 aa  608  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2453  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  53.05 
 
 
606 aa  603  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.633572  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4598  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.22 
 
 
606 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.92 
 
 
609 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2933  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.98 
 
 
609 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.850684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  49.92 
 
 
609 aa  571  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  49.92 
 
 
609 aa  571  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  49.92 
 
 
609 aa  571  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.92 
 
 
609 aa  571  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4086  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.92 
 
 
609 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5165  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.76 
 
 
609 aa  569  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0121  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.84 
 
 
609 aa  572  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4250  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.92 
 
 
609 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.92 
 
 
609 aa  571  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.92 
 
 
609 aa  571  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.92 
 
 
609 aa  571  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.92 
 
 
609 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.92 
 
 
609 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4142  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.92 
 
 
609 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.65 
 
 
609 aa  565  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.73 
 
 
611 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  51.05 
 
 
616 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2280  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.48 
 
 
615 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0733562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.73 
 
 
611 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.67 
 
 
609 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4564  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.02 
 
 
610 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.41 
 
 
611 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.67 
 
 
609 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.67 
 
 
609 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4463  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  47.8 
 
 
609 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0808  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.52 
 
 
609 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4198  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.94 
 
 
611 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  49.67 
 
 
610 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1512  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.61 
 
 
609 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1805  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.27 
 
 
609 aa  552  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  49.19 
 
 
611 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4261  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.7 
 
 
610 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.45 
 
 
610 aa  551  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0270  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.28 
 
 
609 aa  549  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0090  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.63 
 
 
609 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0489544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.04 
 
 
609 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.35 
 
 
610 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0104  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.77 
 
 
609 aa  548  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521795  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  47.81 
 
 
617 aa  549  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  51.46 
 
 
610 aa  549  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.08 
 
 
611 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.73 
 
 
610 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6331  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.43 
 
 
605 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.43 
 
 
610 aa  548  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0073  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.46 
 
 
609 aa  548  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.653e-29 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.86 
 
 
609 aa  548  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.63 
 
 
611 aa  547  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1487  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.67 
 
 
609 aa  544  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2397  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.36 
 
 
614 aa  544  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.63 
 
 
612 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.225052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0093  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.34 
 
 
609 aa  544  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>