More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2057 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4418  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  67.11 
 
 
607 aa  837    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1801  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  63.5 
 
 
611 aa  764    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0582  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.95 
 
 
607 aa  797    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0623132  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4157  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  68.75 
 
 
608 aa  833    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.717296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4598  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.43 
 
 
606 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1164  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.78 
 
 
603 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402042  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2934  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  78.29 
 
 
608 aa  967    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.729718  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  91.12 
 
 
608 aa  1133    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0607297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0008  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.06 
 
 
607 aa  715    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.382171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  82.4 
 
 
608 aa  1049    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2418  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  69.41 
 
 
608 aa  859    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316108  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.55 
 
 
608 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487309  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.95 
 
 
603 aa  693    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0810967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1404  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.55 
 
 
608 aa  776    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247017  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4910  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  59.77 
 
 
608 aa  755    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4640  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  68.42 
 
 
608 aa  815    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.972061  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1910  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.88 
 
 
608 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701162  normal  0.896342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1293  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.39 
 
 
606 aa  687    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921081  normal  0.297971 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0755  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.89 
 
 
607 aa  741    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.255039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.22 
 
 
607 aa  726    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3375  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  68.75 
 
 
608 aa  849    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  66.45 
 
 
607 aa  810    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2854  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  80.43 
 
 
608 aa  967    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1202  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.18 
 
 
607 aa  737    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10337  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3186  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.74 
 
 
602 aa  671    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2606  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  82.4 
 
 
608 aa  1018    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659057  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6177  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.38 
 
 
608 aa  771    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1826  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  68.09 
 
 
608 aa  839    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3067  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  63.16 
 
 
607 aa  768    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.82118  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2618  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  80.92 
 
 
608 aa  989    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0708  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  63.24 
 
 
612 aa  778    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2057  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  100 
 
 
608 aa  1232    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776595  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2017  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  59.28 
 
 
603 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.851837  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.24 
 
 
602 aa  689    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1366  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.03 
 
 
607 aa  716    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1706  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.98 
 
 
607 aa  797    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4553  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.59 
 
 
608 aa  719    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365808 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0547  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.95 
 
 
607 aa  797    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4526  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  68.75 
 
 
608 aa  833    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697657  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5508  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  68.75 
 
 
608 aa  852    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2171  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.37 
 
 
608 aa  781    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0619  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.8 
 
 
605 aa  699    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247891  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2276  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  58.55 
 
 
607 aa  676    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5030  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.43 
 
 
608 aa  747    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4068  hypothetical protein  55.43 
 
 
603 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.035977  normal  0.145106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2453  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  53.69 
 
 
606 aa  617  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.633572  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3455  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  51.39 
 
 
610 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.81 
 
 
611 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50 
 
 
611 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0073  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.61 
 
 
609 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.653e-29 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50 
 
 
611 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0090  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.77 
 
 
609 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0489544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.92 
 
 
616 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0270  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.51 
 
 
609 aa  571  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0121  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.11 
 
 
609 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  48.86 
 
 
613 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.851914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.24 
 
 
611 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2933  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.61 
 
 
609 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.850684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1512  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.45 
 
 
609 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.55 
 
 
610 aa  560  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1805  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.13 
 
 
609 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.43 
 
 
609 aa  560  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1487  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.75 
 
 
609 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51890  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  50.98 
 
 
611 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0808  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.03 
 
 
609 aa  558  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0104  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.45 
 
 
609 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521795  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0103  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.1 
 
 
609 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  48.94 
 
 
610 aa  557  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.61 
 
 
609 aa  552  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  47.31 
 
 
608 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  47.17 
 
 
617 aa  551  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.29 
 
 
609 aa  552  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.46 
 
 
609 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  47.63 
 
 
610 aa  549  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.94 
 
 
611 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.78 
 
 
609 aa  548  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2397  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.5 
 
 
614 aa  549  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.7 
 
 
605 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2982  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.7 
 
 
605 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  47.46 
 
 
609 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  47.46 
 
 
609 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  47.46 
 
 
609 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.8 
 
 
609 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.34 
 
 
614 aa  546  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.666768  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.79 
 
 
609 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.63 
 
 
610 aa  548  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.46 
 
 
609 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.46 
 
 
609 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3002  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.54 
 
 
605 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978616  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.46 
 
 
609 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.46 
 
 
609 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0010  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  49.35 
 
 
606 aa  547  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.675928  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.46 
 
 
609 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4142  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.3 
 
 
609 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  47.19 
 
 
611 aa  544  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  48.2 
 
 
611 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.63 
 
 
609 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.95 
 
 
609 aa  542  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.63 
 
 
609 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  47.63 
 
 
609 aa  544  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>